|
Эта публикация цитируется в 2 научных статьях (всего в 2 статьях)
Математическое моделирование
Использование связных масок в задаче восстановления изображения изолированной частицы по данным рентгеновского рассеяния. III. Стратегии отбора решений по результатам максимизации правдоподобия
Н. Л. Лунинаa, Т. Е. Петроваa, А. Г. Уржумцевbc, В. Ю. Лунинa a Институт математических проблем биологии РАН – филиал Института прикладной
математики им. М.В.Келдыша РАН, Пущино, Московская область, 142290, Россия
b Лорренский университет, Вандевр-ле-Нанси, 54506, Франция
c Институт генетики и молекулярной и клеточной биологии, 67404 Илькирш, Франция
Аннотация:
Основное экспериментальное ограничение биологической кристаллографии связано с необходимостью приготовления исследуемого объекта в виде монокристалла. Ввод в эксплуатацию новых мощных источников рентгеновского излучения — рентгеновских лазеров на свободных электронах — позволяет ставить вопрос о практическом определении структуры изолированных биологических макромолекул и их комплексов. Дополнительным преимуществом работы с изолированными частицами является возможность получения информации о рассеянии во всех направлениях, а не только направлениях, ограниченных условиями дифракции Лауэ–Брэгга. Это существенно облегчает решение фазовой проблемы рентгеноструктурного анализа — определения значений фаз структурных факторов, недоступных для измерения в эксперименте. Данная работа посвящена двум направлениям развития предложенного ранее авторами метода решения фазовой проблемы, основанного на случайном сканировании конфигурационного пространства потенциальных решений фазовой проблемы. В работе предложен новый тип критерия отбора в процессе сканирования кандидатов на решение фазовой проблемы, включающий максимизацию статистического правдоподобия, и показана (в тестовых расчетах) его эффективность. Второе направление связано с выбором оптимальной стратегии сканирования. Показано, что в данном подходе постепенное расширение используемого в работе набора экспериментальных данных позволяет получать решения более высокого качества, нежели при одновременном включении в работу всех имеющихся данных. Такое расширение может осуществляться в неявном виде использованием в работе синтезов Фурье электронной плотности, взвешенных показателями достоверности имеющихся значений фаз.
Ключевые слова:
рентгеновская кристаллография, фазовая проблема, XFEL, рассеяние изолированной частицей.
Материал поступил в редакцию 29.11.2017, опубликован 13.12.2017
Образец цитирования:
Н. Л. Лунина, Т. Е. Петрова, А. Г. Уржумцев, В. Ю. Лунин, “Использование связных масок в задаче восстановления изображения изолированной частицы по данным рентгеновского рассеяния. III. Стратегии отбора решений по результатам максимизации правдоподобия”, Матем. биология и биоинформ., 12:2 (2017), 521–535
Образцы ссылок на эту страницу:
https://www.mathnet.ru/rus/mbb310 https://www.mathnet.ru/rus/mbb/v12/i2/p521
|
Статистика просмотров: |
Страница аннотации: | 205 | PDF полного текста: | 39 | Список литературы: | 23 |
|