Математическая биология и биоинформатика
RUS  ENG    ЖУРНАЛЫ   ПЕРСОНАЛИИ   ОРГАНИЗАЦИИ   КОНФЕРЕНЦИИ   СЕМИНАРЫ   ВИДЕОТЕКА   ПАКЕТ AMSBIB  
Общая информация
Последний выпуск
Архив
Импакт-фактор

Поиск публикаций
Поиск ссылок

RSS
Последний выпуск
Текущие выпуски
Архивные выпуски
Что такое RSS



Матем. биология и биоинформ.:
Год:
Том:
Выпуск:
Страница:
Найти






Персональный вход:
Логин:
Пароль:
Запомнить пароль
Войти
Забыли пароль?
Регистрация


Математическая биология и биоинформатика, 2014, том 9, выпуск 2, страницы 543–562 (Mi mbb199)  

Эта публикация цитируется в 5 научных статьях (всего в 5 статьях)

Математическое моделирование

Использование связных масок в задаче восстановления изображения изолированной частицы по данным рентгеновского рассеяния

В. Ю. Лунин, Н. Л. Лунина, Т. Е. Петрова

Институт математических проблем биологии, Российская академия наук, Пущино, Московская область, 142290, Россия
Список литературы:
Аннотация: Задача восстановления изображения изолированного макромолекулярного объекта по данным рентгеновского рассеяния может быть сформулирована как задача восстановления трехмерного распределения электронной плотности по модулю его преобразования Фурье. Эта задача может быть редуцирована к серии стандартных задач рентгеновской кристаллографии – восстановлению значений периодической функции по значениям модулей ее коэффициентов Фурье (структурных факторов), экспериментально определяемых в рентгеновском эксперименте. В данной работе предлагается новый подход к решению таких задач, основанный на использовании связных бинарных масок в качестве аппроксимации искомого распределения электронной плотности. Подход включает в себя: случайную генерацию большого числа связных масок; отбор масок, согласующихся с экспериментальной и априорной информацией об объекте; выравнивание и усреднение наборов фаз структурных факторов, соответствующих отобранным маскам. Усредненные значения фаз используются вместе с экспериментально определенными значениями модулей структурных факторов для расчета синтеза Фурье, используемого для визуализации изучаемого объекта. Предложенный подход может применяться как при исследовании изолированных частиц, так и кристаллических образцов, однако демонстрирует наибольшие перспективы при работе с изолированными объектами. Приведены результаты тестирования предложенного подхода.
Ключевые слова: рентгеновская кристаллография, фазовая проблема, XFEL, рассеяние изолированной частицей.
Материал поступил в редакцию 08.12.2014, опубликован 19.12.2014
Тип публикации: Статья
УДК: 577.3
Образец цитирования: В. Ю. Лунин, Н. Л. Лунина, Т. Е. Петрова, “Использование связных масок в задаче восстановления изображения изолированной частицы по данным рентгеновского рассеяния”, Матем. биология и биоинформ., 9:2 (2014), 543–562
Цитирование в формате AMSBIB
\RBibitem{LunLunPet14}
\by В.~Ю.~Лунин, Н.~Л.~Лунина, Т.~Е.~Петрова
\paper Использование связных масок в задаче восстановления изображения изолированной частицы по данным рентгеновского рассеяния
\jour Матем. биология и биоинформ.
\yr 2014
\vol 9
\issue 2
\pages 543--562
\mathnet{http://mi.mathnet.ru/mbb199}
Образцы ссылок на эту страницу:
  • https://www.mathnet.ru/rus/mbb199
  • https://www.mathnet.ru/rus/mbb/v9/i2/p543
    Цикл статей Перевод статьи
    Эта публикация цитируется в следующих 5 статьяx:
    1. Т. Е. Петрова, В. Ю. Лунин, “Определение структуры биологических макромолекулярных частиц с использованием рентгеновских лазеров. Достижения и перспективы”, Матем. биология и биоинформ., 15:2 (2020), 195–234  mathnet  crossref
    2. В. Ю. Лунин, Н. Л. Лунина, Т. Е. Петрова, “Исследование одиночных частиц дифракционными методами: кристаллографический подход”, Матем. биология и биоинформ., 14, Suppl. (2019), 44–61  mathnet  crossref
    3. В. Ю. Лунин, Н. Л. Лунина, Т. Е. Петрова, “Биологическая кристаллография без кристаллов”, Матем. биология и биоинформ., 12:1 (2017), 55–72  mathnet  crossref
    4. Н. Л. Лунина, Т. Е. Петрова, А. Г. Уржумцев, В. Ю. Лунин, “Использование связных масок в задаче восстановления изображения изолированной частицы по данным рентгеновского рассеяния. III. Стратегии отбора решений по результатам максимизации правдоподобия”, Матем. биология и биоинформ., 12:2 (2017), 521–535  mathnet  crossref
    5. Н. Л. Лунина, Т. Е. Петрова, А. Г. Уржумцев, В. Ю. Лунин, “Использование связных масок в задаче восстановления изображения изолированной частицы по данным рентгеновского рассеяния. II. Зависимость точности решения от шага дискретизации экспериментальных данных”, Матем. биология и биоинформ., 10:2 (2015), 508–525  mathnet  crossref
    Citing articles in Google Scholar: Russian citations, English citations
    Related articles in Google Scholar: Russian articles, English articles
    Статистика просмотров:
    Страница аннотации:261
    PDF полного текста:71
    Список литературы:47
     
      Обратная связь:
     Пользовательское соглашение  Регистрация посетителей портала  Логотипы © Математический институт им. В. А. Стеклова РАН, 2025