Математическая биология и биоинформатика
RUS  ENG    ЖУРНАЛЫ   ПЕРСОНАЛИИ   ОРГАНИЗАЦИИ   КОНФЕРЕНЦИИ   СЕМИНАРЫ   ВИДЕОТЕКА   ПАКЕТ AMSBIB  
Общая информация
Последний выпуск
Архив
Импакт-фактор

Поиск публикаций
Поиск ссылок

RSS
Последний выпуск
Текущие выпуски
Архивные выпуски
Что такое RSS



Матем. биология и биоинформ.:
Год:
Том:
Выпуск:
Страница:
Найти






Персональный вход:
Логин:
Пароль:
Запомнить пароль
Войти
Забыли пароль?
Регистрация


Математическая биология и биоинформатика, 2015, том 10, выпуск Suppl., страницы t1–t19
DOI: https://doi.org/10.17537/2015.10.t1
(Mi mbb318)
 

Эта публикация цитируется в 2 научных статьях (всего в 2 статьях)

Переводы опубликованных статей

The use of connected masks for reconstructing the single particle image from X-ray diffraction data

V. Y. Lunin, N. L. Lunina, T. E. Petrova

Institute of Mathematical Problems of Biology, Russian Academy of Sciences, Pushchino, Moscow Region, 142290, Russia
Список литературы:
Аннотация: The problem of reconstructing the image of a single macromolecular object from X-ray diffraction data can be formulated as a problem of the reconstruction of the 3D electron density distribution from the magnitudes of its Fourier transform. This problem can be reduced to a series of standard X-ray crystallography tasks, namely, the recovery of a periodic function from its Fourier coefficients (structure factors) magnitudes, which are determined in an X-ray diffraction experiment. In this work, a new approach to the solution of these tasks is suggested which is based on the use of connected binary masks as an approximation of the required electron density distribution. The approach includes the random generation of a great number of connected masks, the selection of the masks that are in agreement with an experimental and a priori information about the object, and the alignment and the averaging of the phase sets of the structure factors that correspond to the selected masks. The averaged phase values together with the experimentally determined magnitudes are used for the calculation of the Fourier synthesis, which is applied for the visualization of the object under study. The approach can be used in studies of both single particles and crystalline species; however, it holds the greatest promise for investigations of single objects. The results of testing the approach are presented.
Ключевые слова: X-ray crystallography, phase problem, XFEL, scattering by a single particle.
Финансовая поддержка Номер гранта
Российский фонд фундаментальных исследований 13-04-00118_а
The work was supported by the Russian Foundation for Basic Research (grant No. 13-04-00118).
Материал поступил в редакцию 31.03.2015, опубликован 08.04.2015
Тип публикации: Статья
УДК: 577.3
Язык публикации: английский
Образец цитирования: V. Y. Lunin, N. L. Lunina, T. E. Petrova, “The use of connected masks for reconstructing the single particle image from X-ray diffraction data”, Матем. биология и биоинформ., 10, Suppl. (2015), t1–t19
Цитирование в формате AMSBIB
\RBibitem{LunLunPet15}
\by V.~Y.~Lunin, N.~L.~Lunina, T.~E.~Petrova
\paper The use of connected masks for reconstructing the single particle image from X-ray diffraction data
\jour Матем. биология и биоинформ.
\yr 2015
\vol 10
\pages t1--t19
\issueinfo Suppl.
\mathnet{http://mi.mathnet.ru/mbb318}
\crossref{https://doi.org/10.17537/2015.10.t1}
Образцы ссылок на эту страницу:
  • https://www.mathnet.ru/rus/mbb318
  • https://www.mathnet.ru/rus/mbb/v10/i3/p1
    Цикл статей Перевод статьи
    Эта публикация цитируется в следующих 2 статьяx:
    Citing articles in Google Scholar: Russian citations, English citations
    Related articles in Google Scholar: Russian articles, English articles
     
      Обратная связь:
     Пользовательское соглашение  Регистрация посетителей портала  Логотипы © Математический институт им. В. А. Стеклова РАН, 2024