Математическая биология и биоинформатика
RUS  ENG    ЖУРНАЛЫ   ПЕРСОНАЛИИ   ОРГАНИЗАЦИИ   КОНФЕРЕНЦИИ   СЕМИНАРЫ   ВИДЕОТЕКА   ПАКЕТ AMSBIB  
Общая информация
Последний выпуск
Архив
Импакт-фактор

Поиск публикаций
Поиск ссылок

RSS
Последний выпуск
Текущие выпуски
Архивные выпуски
Что такое RSS



Матем. биология и биоинформ.:
Год:
Том:
Выпуск:
Страница:
Найти






Персональный вход:
Логин:
Пароль:
Запомнить пароль
Войти
Забыли пароль?
Регистрация


Математическая биология и биоинформатика, 2015, том 10, выпуск Suppl., страницы t56–t72
DOI: https://doi.org/10.17537/2015.10.t56
(Mi mbb322)
 

Эта публикация цитируется в 3 научных статьях (всего в 3 статьях)

Переводы опубликованных статей

The use of connected masks for reconstructing the single particle image from X-ray diffraction data. II. The dependence of the accuracy of the solution on the sampling step of experimental data

N. L. Luninaa, T. E. Petrovaa, A. G. Urzhumtsevbc, V. Y. Lunina

a Institute of Mathematical Problems of Biology, Moscow Region, Pushchino, Russia
b Université de Lorraine, Vandoeuvre-lès-Nancy, France
c Institut de Génétique et de Biologie Moléculaire et Cellulaire, Illkirch, France
Список литературы:
Аннотация: Advances in the methodology of the X-ray diffraction experiments leads to a possibility to register the rays scattered by large isolated biological particles (viruses and individual cells) but not only by crystalline samples. The experiment with an isolated particle provides researchers with the intensities of the scattered rays for the continuous spectrum of scattering vectors. Such experiment gives much more experimental data than an experiment with a crystalline sample where the information is limited to a set of Bragg reflections. This opens up additional opportunities in solving underlying problem of X-ray crystallography, namely, calculating phase values for the scattered waves needed to restore the structure of the object under study. In practice, the original continuous diffraction pattern is sampled, reduced to the values at grid points in the space of scattering vectors (in the reciprocal space). The sampling step determines the amount of the information involved in solving the phase problem and the complexity of the necessary calculations. In this paper, we investigate the effect of the sampling step on the accuracy of the phase problem solution obtained by the method proposed earlier by the authors. It is shown that an expected improvement of the accuracy of the solution with the reducing the sampling step continues even after crossing the 'Nyquist limit' defined as the inverse of the double size of the object under study.
Ключевые слова: X-ray crystallography, phase problem, XFEL, single particle diffraction.
Финансовая поддержка Номер гранта
Российский фонд фундаментальных исследований 13-04-00118_а
This work was supported by a grant of RFBR (project No. 13-04-00118).
Материал поступил в редакцию 15.12.2015, опубликован 23.12.2015
Тип публикации: Статья
УДК: 577.3
Язык публикации: английский
Образец цитирования: N. L. Lunina, T. E. Petrova, A. G. Urzhumtsev, V. Y. Lunin, “The use of connected masks for reconstructing the single particle image from X-ray diffraction data. II. The dependence of the accuracy of the solution on the sampling step of experimental data”, Матем. биология и биоинформ., 10, Suppl. (2015), t56–t72
Цитирование в формате AMSBIB
\RBibitem{LunPetUrz15}
\by N.~L.~Lunina, T.~E.~Petrova, A.~G.~Urzhumtsev, V.~Y.~Lunin
\paper The use of connected masks for reconstructing the single particle image from X-ray diffraction data. II.~The dependence of the accuracy of the solution on the sampling step of experimental data
\jour Матем. биология и биоинформ.
\yr 2015
\vol 10
\pages t56--t72
\issueinfo Suppl.
\mathnet{http://mi.mathnet.ru/mbb322}
\crossref{https://doi.org/10.17537/2015.10.t56}
Образцы ссылок на эту страницу:
  • https://www.mathnet.ru/rus/mbb322
  • https://www.mathnet.ru/rus/mbb/v10/i3/p56
    Цикл статей Перевод статьи
    Эта публикация цитируется в следующих 3 статьяx:
    Citing articles in Google Scholar: Russian citations, English citations
    Related articles in Google Scholar: Russian articles, English articles
    Статистика просмотров:
    Страница аннотации:118
    PDF полного текста:30
    Список литературы:28
     
      Обратная связь:
     Пользовательское соглашение  Регистрация посетителей портала  Логотипы © Математический институт им. В. А. Стеклова РАН, 2024