Аннотация:
“Чувство кворума”, представляющее один из видов бактериальной коммуникации, может быть исследовано с использованием средств и методов математического и компьютерного моделирования. В настоящей работе предложена модификация детерминированной математической модели бактериального чувства кворума с учетом закона многофазной динамики популяций. Математическая модель формализована в виде начально-краевой задачи для системы полулинейных уравнений в частных производных типа “реакция-диффузия”. Динамика изменения плотности биомассы учтена в генерационных слагаемых модельных уравнений. Модель описывает изменение концентрации специальных химических субстанций – сигнального вещества и фермента лактоназы, характеризующих чувство кворума у грамотрицательных бактерий. Задача решается методом конечных элементов с использованием платформы COMSOL Multiphysics. Проведены вычислительные эксперименты по оценке концентраций ключевых веществ, характеризующих чувство кворума, для бактериального вида Pseudomonas putida в расширенном диапазоне динамики популяции.
Ключевые слова:
бактериальная коммуникация, чувство кворума, модель реакции-диффузии, бактериальная динамика, конечно-элементное моделирование, моделирование распределения химических соединений.
This study was supported by the Ministry of Science and Higher Education of the Russian Federation (project no. 122082400001-8).
Материал поступил в редакцию 11.11.2022, 09.03.2023, опубликован 29.03.2023
Тип публикации:
Статья
Язык публикации: английский
Образец цитирования:
Y. Shuai, A. G. Maslovskaya, C. Kuttler, “Modeling of bacterial communication in the extended range of population dynamics”, Матем. биология и биоинформ., 18:1 (2023), 89–104
\RBibitem{ShuMasKut23}
\by Y.~Shuai, A.~G.~Maslovskaya, C.~Kuttler
\paper Modeling of bacterial communication in the extended range of population dynamics
\jour Матем. биология и биоинформ.
\yr 2023
\vol 18
\issue 1
\pages 89--104
\mathnet{http://mi.mathnet.ru/mbb510}
\crossref{https://doi.org/10.17537/2023.18.89}