Математическая биология и биоинформатика
RUS  ENG    ЖУРНАЛЫ   ПЕРСОНАЛИИ   ОРГАНИЗАЦИИ   КОНФЕРЕНЦИИ   СЕМИНАРЫ   ВИДЕОТЕКА   ПАКЕТ AMSBIB  
Общая информация
Последний выпуск
Архив
Импакт-фактор

Поиск публикаций
Поиск ссылок

RSS
Последний выпуск
Текущие выпуски
Архивные выпуски
Что такое RSS



Матем. биология и биоинформ.:
Год:
Том:
Выпуск:
Страница:
Найти






Персональный вход:
Логин:
Пароль:
Запомнить пароль
Войти
Забыли пароль?
Регистрация


Математическая биология и биоинформатика, 2020, том 15, выпуск 1, страницы 4–19
DOI: https://doi.org/10.17537/2020.15.4
(Mi mbb419)
 

Эта публикация цитируется в 2 научных статьях (всего в 2 статьях)

Биоинформатика

Подход к отбору значимых признаков при решении биомедицинских задач бинарной классификации данных с микрочипов

И. Ю. Бойко, Д. С. Анисимов, Л. Л. Смолякова, М. А. Рязанов

Алтайский государственный университет, Барнаул, Россия
Список литературы:
Аннотация: В ряде современных биомедицинских исследований, направленных на поиск методов ранней диагностики онкологических заболеваний, используются микрочипы, содержащие определенную биологическую информацию о пациентах. На основе этих данных происходит отнесение пациентов к одному из двух классов, соответствующих наличию и отсутствию у пациента некоторого диагноза. При решении данной задачи отбор значимых признаков является одним из этапов, оказывающих решающее влияние на качество классификации. В данной работе предлагается критерий отбора значимых признаков, основанный на использовании ledge-коэффициента корреляции, введенного ранее для оценки степени взаимосвязи числового и бинарного признаков. Для двух наборов данных с микрочипов приведены сравнительные примеры их бинарной классификации с использованием трех алгоритмов отбора признаков, трех методов уменьшения размерности, шести моделей классификации. Использование ledge-критерия отбора признаков позволило получить качество классификации, сравнимое с результатами использования распространенных методов отбора признаков, таких как: $t$-критерий, $U$-критерий. Для рассмотренного в работе набора данных с пептидных микрочипов ранее была выявлена эффективность применения метода проекции на латентные структуры. Использование этого метода в сочетании с отбором значимых признаков ledge-критерием позволило получить более высокий показатель качества классификации.
Ключевые слова: отбор признаков, ledge-коэффициент, бинарная классификация, микрочипы, ROC-кривая, метод проекции на латентные структуры.
Финансовая поддержка Номер гранта
Российский фонд фундаментальных исследований 17-04-00321
Работа выполнена при финансовой поддержке РФФИ в рамках научного проекта № 17-04-00321.
Материал поступил в редакцию 18.07.2019, 15.01.2020, опубликован 30.01.2020
Тип публикации: Статья
Образец цитирования: И. Ю. Бойко, Д. С. Анисимов, Л. Л. Смолякова, М. А. Рязанов, “Подход к отбору значимых признаков при решении биомедицинских задач бинарной классификации данных с микрочипов”, Матем. биология и биоинформ., 15:1 (2020), 4–19
Цитирование в формате AMSBIB
\RBibitem{BoiAniSmo20}
\by И.~Ю.~Бойко, Д.~С.~Анисимов, Л.~Л.~Смолякова, М.~А.~Рязанов
\paper Подход к отбору значимых признаков при решении биомедицинских задач бинарной классификации данных с микрочипов
\jour Матем. биология и биоинформ.
\yr 2020
\vol 15
\issue 1
\pages 4--19
\mathnet{http://mi.mathnet.ru/mbb419}
\crossref{https://doi.org/10.17537/2020.15.4}
Образцы ссылок на эту страницу:
  • https://www.mathnet.ru/rus/mbb419
  • https://www.mathnet.ru/rus/mbb/v15/i1/p4
  • Эта публикация цитируется в следующих 2 статьяx:
    Citing articles in Google Scholar: Russian citations, English citations
    Related articles in Google Scholar: Russian articles, English articles
    Статистика просмотров:
    Страница аннотации:110
    PDF полного текста:120
    Список литературы:26
     
      Обратная связь:
     Пользовательское соглашение  Регистрация посетителей портала  Логотипы © Математический институт им. В. А. Стеклова РАН, 2024