Математическая биология и биоинформатика
RUS  ENG    ЖУРНАЛЫ   ПЕРСОНАЛИИ   ОРГАНИЗАЦИИ   КОНФЕРЕНЦИИ   СЕМИНАРЫ   ВИДЕОТЕКА   ПАКЕТ AMSBIB  
Общая информация
Последний выпуск
Архив
Импакт-фактор

Поиск публикаций
Поиск ссылок

RSS
Последний выпуск
Текущие выпуски
Архивные выпуски
Что такое RSS



Матем. биология и биоинформ.:
Год:
Том:
Выпуск:
Страница:
Найти






Персональный вход:
Логин:
Пароль:
Запомнить пароль
Войти
Забыли пароль?
Регистрация


Математическая биология и биоинформатика, 2019, том 14, выпуск Suppl., страницы t18–t36
DOI: https://doi.org/10.17537/2019.14.t18
(Mi mbb414)
 

Эта публикация цитируется в 4 научных статьях (всего в 4 статьях)

Переводы опубликованных статей

Statistical analysis of internal distances of helical pairs in protein molecules
[Статистический анализ внутренних расстояний спиральных пар в белковых молекулах]

D. A. Tikhonova, L. I. Kulikovaa, A. V. Efimovb

a Institute of Mathematical Problems of Biology RAS – the Branch of Keldysh Institute of Applied Mathematics, Russian Academy of Sciences, Pushchino, Russia
b Institute of Protein Research, Russian Academy of Sciences, Pushchino, Russia
Список литературы:
Аннотация: В данной работе проведен статистический анализ распределения межспиральных расстояний в парах связанных между собой перетяжками спиралей в пространственных структурах белковых молекул. Полученное по определенным правилам множество спиральных пар всех белковых молекул, включенных в Protein Data Bank, разбито на три подмножества по критерию пересечения проекций спиралей на параллельные плоскости, проходящие через оси спиралей. Показано, что распределения расстояний для спиральных пар, проекции которых не имеют пересечений, имеют более дальнодействующий характер, чем те, проекции которых пересекаются. При помощи регрессионного анализа исследован характер распределений, в частности, показано, что в подмножестве без пересечений распределения различных расстояний между осями спиралей относятся к гамма-распределениям. Показано, что подмножества пар с пересечением имеют с большой вероятностью малое отношение минимального расстояния к межплоскостному, в отличие от подмножества пар без пересечения, где наблюдается противоположная картина. Обосновывается вывод о том, что спиральные пары, проекции спиралей которых пересекаются, дополнительно стабилизируются за счет внутренних взаимодействий.
Ключевые слова: структурные мотивы белков, спиральные пары в белковых молекулах, точечная модель, статистический анализ, межплоскостное расстояние, минимальное расстояние между осями спиралей.
Финансовая поддержка Номер гранта
Российский фонд фундаментальных исследований 18-07-01031
Материал поступил в редакцию 24.03.2019, опубликован 25.04.2019
Тип публикации: Статья
УДК: 519.2
Язык публикации: английский
Образец цитирования: D. A. Tikhonov, L. I. Kulikova, A. V. Efimov, “Statistical analysis of internal distances of helical pairs in protein molecules”, Матем. биология и биоинформ., 14, Suppl. (2019), t18–t36
Цитирование в формате AMSBIB
\RBibitem{TikKulEfi19}
\by D.~A.~Tikhonov, L.~I.~Kulikova, A.~V.~Efimov
\paper Statistical analysis of internal distances of helical pairs in protein molecules
\jour Матем. биология и биоинформ.
\yr 2019
\vol 14
\pages t18--t36
\issueinfo Suppl.
\mathnet{http://mi.mathnet.ru/mbb414}
\crossref{https://doi.org/10.17537/2019.14.t18}
Образцы ссылок на эту страницу:
  • https://www.mathnet.ru/rus/mbb414
  • https://www.mathnet.ru/rus/mbb/v14/i3/p18
    Перевод статьи
    Эта публикация цитируется в следующих 4 статьяx:
    Citing articles in Google Scholar: Russian citations, English citations
    Related articles in Google Scholar: Russian articles, English articles
    Статистика просмотров:
    Страница аннотации:106
    PDF полного текста:43
    Список литературы:21
     
      Обратная связь:
     Пользовательское соглашение  Регистрация посетителей портала  Логотипы © Математический институт им. В. А. Стеклова РАН, 2024