Аннотация:
Увеличение мощности источников рентгеновского излучения (в частности, ввод в эксплуатацию рентгеновских лазеров на свободных электронах) открывает возможности практической регистрации рассеяния одиночными макромолекулярными биологическими частицами. Такая возможность создает предпосылки для ослабления (в идеале – снятия) основного ограничения рентгеноструктурного анализа – необходимости приготовления образца исследуемого объекта в виде монокристалла. Однако в настоящее время возможность практической регистрации рассеяния изолированной частицей ограничена зоной очень низкого разрешения, что является одной из основных проблем при развития этого подхода. В данной работе обсуждается сходство и отличия в исследовании кристаллических образцов и одиночных экземпляров исследуемых объектов. Показано, что задача определения структуры изолированной частицы может быть сформулирована как стандартная задача биологической кристаллографии, т.е. как задача определения распределения электронной плотности в элементарной ячейке виртуального кристалла по известным модулям комплексных коэффициентов Фурье этого распределения. Это позволяет применять к исследованию изолированных частиц весь арсенал методов биологической кристаллографии. В то же время, возможность регистрации для изолированной частицы непрерывной картины рассеяния (в отличие от дискретного набора Брэгговских рефлексов в случае кристалла) существенно увеличивает объем информации, извлекаемой из эксперимента. Аналитические свойства функции, описывающей непрерывное распределение интенсивности рассеянных лучей, создают потенциальную возможность как для решения фазовой проблемы – восстановления потерянных в эксперименте значений фаз коэффициентов Фурье, так и для экстраполяции наблюденных значений на более широкую область, позволяющую повысить разрешение получаемых синтезов Фурье.
Материал поступил в редакцию 25.09.2019, 27.10.2019, опубликован 07.11.2019
Тип публикации:
Статья
УДК:
577.3, 548, 519.6
Язык публикации: английский
Образец цитирования:
V. Yu. Lunin, N. L. Lunina, T. E. Petrova, “Single particle study by X-ray diffraction: crystallographic approach”, Матем. биология и биоинформ., 14:2 (2019), 500–516
T. E. Petrova, V. Yu. Lunin, “Determination of the structure of biological macromolecular particles using X-ray lasers. Achievements and prospects”, Матем. биология и биоинформ., 15, Suppl. (2020), 52–87
V. Yu. Lunin, N. L. Lunina, T. E. Petrova, “Восстановление модулей и расчет фаз для дифракционной картины изолированной частицы с использованием бинарных масок объекта”, Матем. биология и биоинформ., 15:1 (2020), 57–72