|
Эта публикация цитируется в 2 научных статьях (всего в 2 статьях)
Математическое моделирование
Single particle study by X-ray diffraction: crystallographic approach
[Исследование одиночных частиц дифракционными методами: кристаллографический подход]
V. Yu. Lunin, N. L. Lunina, T. E. Petrova Institute of Mathematical Problems of Biology RAS, Keldysh Institute of Applied Mathematics of Russian Academy of Sciences, Pushchino, Russia
Аннотация:
Увеличение мощности источников рентгеновского излучения (в частности, ввод в эксплуатацию рентгеновских лазеров на свободных электронах) открывает возможности практической регистрации рассеяния одиночными макромолекулярными биологическими частицами. Такая возможность создает предпосылки для ослабления (в идеале – снятия) основного ограничения рентгеноструктурного анализа – необходимости приготовления образца исследуемого объекта в виде монокристалла. Однако в настоящее время возможность практической регистрации рассеяния изолированной частицей ограничена зоной очень низкого разрешения, что является одной из основных проблем при развития этого подхода. В данной работе обсуждается сходство и отличия в исследовании кристаллических образцов и одиночных экземпляров исследуемых объектов. Показано, что задача определения структуры изолированной частицы может быть сформулирована как стандартная задача биологической кристаллографии, т.е. как задача определения распределения электронной плотности в элементарной ячейке виртуального кристалла по известным модулям комплексных коэффициентов Фурье этого распределения. Это позволяет применять к исследованию изолированных частиц весь арсенал методов биологической кристаллографии. В то же время, возможность регистрации для изолированной частицы непрерывной картины рассеяния (в отличие от дискретного набора Брэгговских рефлексов в случае кристалла) существенно увеличивает объем информации, извлекаемой из эксперимента. Аналитические свойства функции, описывающей непрерывное распределение интенсивности рассеянных лучей, создают потенциальную возможность как для решения фазовой проблемы – восстановления потерянных в эксперименте значений фаз коэффициентов Фурье, так и для экстраполяции наблюденных значений на более широкую область, позволяющую повысить разрешение получаемых синтезов Фурье.
Ключевые слова:
биологические макромолекулы, изолированные частицы, рентгеновское рассеяние, рентгеновские лазеры, фазовая проблема, разрешение синтезов Фурье.
Материал поступил в редакцию 25.09.2019, 27.10.2019, опубликован 07.11.2019
Образец цитирования:
V. Yu. Lunin, N. L. Lunina, T. E. Petrova, “Single particle study by X-ray diffraction: crystallographic approach”, Матем. биология и биоинформ., 14:2 (2019), 500–516
Образцы ссылок на эту страницу:
https://www.mathnet.ru/rus/mbb399 https://www.mathnet.ru/rus/mbb/v14/i2/p500
|
Статистика просмотров: |
Страница аннотации: | 88 | PDF полного текста: | 29 | Список литературы: | 19 |
|