Comparative analysis of amino acid sequences in particular domains of Hoc proteins in Teequatrovirinae subfamily bacteriophages

В данной работе представлены результаты сравнительного исследования иммуноглобулин-подобных доменов в геномах бактериофагов, родственных бактериофагу T4. Предложено использовать белки Hoc для классификации подсемейства фагов Teequatrovirinae. Осуществлен филогенетический анализ отдельных доменов 31 белка Hoc бактериофагов подсемейства. Показано, что число доменов в белках Hoc у разных бактериофагов подсемейства варьирует от одного до пяти. На основе этого бактериофаги можно разделить на 6 подгрупп. Филогенетическое дерево доменов белков — продуктов генов $\mathrm{hoc}$-бактериофагов, родственных Т4, образует три основные ветви. Это ветвь C-концевых доменов, ветвь N-концевых доменов и ветвь промежуточных доменов. Обязательное присутствие С-концевого домена во всех белках Нос указывает на его функциональную и структурную значимость для формирования белка и его прикрепления к капсиду фага. Сформулированы гипотетические схемы эволюционного происхождения повторяющихся аминокислотных последовательностей в белках Hoc.