Математическая биология и биоинформатика
RUS  ENG    ЖУРНАЛЫ   ПЕРСОНАЛИИ   ОРГАНИЗАЦИИ   КОНФЕРЕНЦИИ   СЕМИНАРЫ   ВИДЕОТЕКА   ПАКЕТ AMSBIB  
Общая информация
Последний выпуск
Архив
Импакт-фактор

Поиск публикаций
Поиск ссылок

RSS
Последний выпуск
Текущие выпуски
Архивные выпуски
Что такое RSS



Матем. биология и биоинформ.:
Год:
Том:
Выпуск:
Страница:
Найти






Персональный вход:
Логин:
Пароль:
Запомнить пароль
Войти
Забыли пароль?
Регистрация


Математическая биология и биоинформатика, 2012, том 7, выпуск 2, страницы 611–631 (Mi mbb126)  

Биоинформатика

Сравнительный анализ аминокислотных последовательностей отдельных доменов белков Hoc бактериофагов подсемейства Teequatrovirinae

А. А. Зиминa, Г. В. Микулинскаяb, Л. Ф. Нигматуллинаa, Н. Н. Назиповаc

a Институт биохимии и физиологии микроорганизмов им. Г. К. Скрябина, Российская академия наук, Пущино, Московская область, 142290, Россия
b Филиал Института биоорганической химии им. академиков М. М. Шемякина и Ю. А. Овчинникова, Российская академия наук, Пущино, Московская область, 142290, Россия
c Институт математических проблем биологии, Российская академия наук, Пущино, Московская область, 142290, Россия
Список литературы:
Аннотация: В данной работе представлены результаты сравнительного исследования иммуноглобулин-подобных доменов в геномах бактериофагов, родственных бактериофагу T4. Предложено использовать белки Hoc для классификации подсемейства фагов Teequatrovirinae. Осуществлен филогенетический анализ отдельных доменов 31 белка Hoc бактериофагов подсемейства. Показано, что число доменов в белках Hoc у разных бактериофагов подсемейства варьирует от одного до пяти. На основе этого бактериофаги можно разделить на 6 подгрупп. Филогенетическое дерево доменов белков — продуктов генов $\mathrm{hoc}$-бактериофагов, родственных Т4, образует три основные ветви. Это ветвь C-концевых доменов, ветвь N-концевых доменов и ветвь промежуточных доменов. Обязательное присутствие С-концевого домена во всех белках Нос указывает на его функциональную и структурную значимость для формирования белка и его прикрепления к капсиду фага. Сформулированы гипотетические схемы эволюционного происхождения повторяющихся аминокислотных последовательностей в белках Hoc.
Ключевые слова: бактериофаг T4, белок Hoc, иммуноглобулин-подобныe белки, домены, филогенетическое дерево, эволюция белков.
Материал поступил в редакцию 11.10.2012, опубликован 26.11.2012
Тип публикации: Статья
УДК: 578.81, 51-76
Образец цитирования: А. А. Зимин, Г. В. Микулинская, Л. Ф. Нигматуллина, Н. Н. Назипова, “Сравнительный анализ аминокислотных последовательностей отдельных доменов белков Hoc бактериофагов подсемейства Teequatrovirinae”, Матем. биология и биоинформ., 7:2 (2012), 611–631
Цитирование в формате AMSBIB
\RBibitem{ZimMikNig12}
\by А.~А.~Зимин, Г.~В.~Микулинская, Л.~Ф.~Нигматуллина, Н.~Н.~Назипова
\paper Сравнительный анализ аминокислотных последовательностей отдельных доменов белков Hoc бактериофагов подсемейства \emph{Teequatrovirinae}
\jour Матем. биология и биоинформ.
\yr 2012
\vol 7
\issue 2
\pages 611--631
\mathnet{http://mi.mathnet.ru/mbb126}
Образцы ссылок на эту страницу:
  • https://www.mathnet.ru/rus/mbb126
  • https://www.mathnet.ru/rus/mbb/v7/i2/p611
    Перевод статьи
    Citing articles in Google Scholar: Russian citations, English citations
    Related articles in Google Scholar: Russian articles, English articles
    Статистика просмотров:
    Страница аннотации:452
    PDF полного текста:128
    Список литературы:47
    Первая страница:1
     
      Обратная связь:
     Пользовательское соглашение  Регистрация посетителей портала  Логотипы © Математический институт им. В. А. Стеклова РАН, 2024