|
Математическая биология и биоинформатика, 2011, том 6, выпуск 2, страницы 161–172
(Mi mbb72)
|
|
|
|
Эта публикация цитируется в 1 научной статье (всего в 1 статье)
Биоинформатика
Компьютерный дизайн потенциальных лекарственных препаратов для терапии СПИДа:
$\beta$-галактозилцерамид и петля V3 белка gp120 ВИЧ-1
И. В. Анищенкоa, А. В. Тузиковa, А. М. Андриановb a Объединенный институт проблем информатики, Национальная академия наук Беларуси, Минск, 220012, Республика Беларусь
b Институт биоорганической химии, Национальная академия наук Беларуси, Минск, 220141, Республика Беларусь
Аннотация:
На основе анализа межмолекулярных взаимодействий гликосфинголипида $\beta$-галактозилцерамида с центральной областью петли V3 ВИЧ-1 осуществлен компьютерный дизайн его двух водорастворимых
аналогов — потенциальных ингибиторов репликации вируса. В результате показано, что ключевую роль в формировании структурных комплексов гликолипидов с петлей V3 ВИЧ-1 играют взаимодействия перекрывающихся $\pi$-орбиталей боковой цепи консервативного фенилаланина ее иммунногенной
«верхушки» Gly-Pro-Gly-Gln/Arg-Ala-Phe с XH (X=C или O) группами остатка сахара. При этом существенный вклад в стабилизацию комплексов вносят водородные связи гидроксильных групп пиранозного кольца галактозы с полярными атомами основной цепи петли V3. Путем расчета
величин энергии связывания сконструированных аналогов $\beta$-галактозилцерамида с пептидами петли V3 предсказана высокая вероятность проявления ими противовирусной активности.
Ключевые слова:
ВИЧ-1, белок gp120, петля V3, $\beta$-галактозилцерамид, трехмерная структура, компьютерное моделирование, лекарственные препараты.
Материал поступил в редакцию 31.05.2011, опубликован 22.07.2011
Образец цитирования:
И. В. Анищенко, А. В. Тузиков, А. М. Андрианов, “Компьютерный дизайн потенциальных лекарственных препаратов для терапии СПИДа:
$\beta$-галактозилцерамид и петля V3 белка gp120 ВИЧ-1”, Матем. биология и биоинформ., 6:2 (2011), 161–172
Образцы ссылок на эту страницу:
https://www.mathnet.ru/rus/mbb72 https://www.mathnet.ru/rus/mbb/v6/i2/p161
|
Статистика просмотров: |
Страница аннотации: | 329 | PDF полного текста: | 89 | Список литературы: | 42 | Первая страница: | 1 |
|