Компьютерный дизайн потенциальных лекарственных препаратов для терапии СПИДа: $\beta$-галактозилцерамид и петля V3 белка gp120 ВИЧ-1

На основе анализа межмолекулярных взаимодействий гликосфинголипида $\beta$-галактозилцерамида с центральной областью петли V3 ВИЧ-1 осуществлен компьютерный дизайн его двух водорастворимых аналогов — потенциальных ингибиторов репликации вируса. В результате показано, что ключевую роль в формировании структурных комплексов гликолипидов с петлей V3 ВИЧ-1 играют взаимодействия перекрывающихся $\pi$-орбиталей боковой цепи консервативного фенилаланина ее иммунногенной «верхушки» Gly-Pro-Gly-Gln/Arg-Ala-Phe с XH (X=C или O) группами остатка сахара. При этом существенный вклад в стабилизацию комплексов вносят водородные связи гидроксильных групп пиранозного кольца галактозы с полярными атомами основной цепи петли V3. Путем расчета величин энергии связывания сконструированных аналогов $\beta$-галактозилцерамида с пептидами петли V3 предсказана высокая вероятность проявления ими противовирусной активности.