|
Математическая биология и биоинформатика, 2011, том 6, выпуск 1, страницы 23–38
(Mi mbb63)
|
|
|
|
Эта публикация цитируется в 1 научной статье (всего в 1 статье)
Материалы Международной конференции «Математическая биология и биоинформатика»
Electronic structure of the active site of truncated hemoglobin $\mathrm N$ in MCSCF approach
[Электронная структура активного центра усеченного гемоглобина $\mathrm N$ в многоконфигурационном методе самосогласованного поля]
K. V. Simon, A. V. Tulub Saint-Petersburg State University
Аннотация:
В приближении многоконфигурационного метода самосогласованного поля (МКССП) выполнен расчет электронных свойств и оптимальной геометрии активного центра гемма $\mathrm{trHbN}$ с включением в состав системы функциональной группы ($\mathrm{ONOO}$) и двух молекул воды. В качестве стартовых молекулярных орбиталей (МО) использованы локализованные МО. В волновой функции метода МКССП заданы два подпространства полного взаимодействия (CAS), это подпространство 3d-орбиталей атома железа и подпространство связывающих и разрыхляющих МО в пероксинитрите плюс орбиталь одной неподеленной электронной пары на фрагменте $\mathrm O_2$. Геометрия анионных структур $\mathrm{(ONOO)}^-$, возникающих в результате переноса заряда с $\mathrm{Fe(II)}$, близка к структурам нитратного аниона и пероксинитрита в газовой фазе. Пероксинитритная структура рассмотрена в двух различных спиновых состояниях, которые соответствуют синглетному и триплетному состояниям этого аниона в газовой фазе. Обсуждается возможная роль пероксинитритной структуры в связи с защитной реакцией M. tuberculosis.
Ключевые слова:
защитная реакция бациллы туберкулеза, электронная структура активного центра гемма, волновые функции многоконфигурационного метода самосогласованного поля (МКССП).
Материал поступил в редакцию 30.12.2010, опубликован 31.01.2011
Образец цитирования:
K. V. Simon, A. V. Tulub, “Electronic structure of the active site of truncated hemoglobin $\mathrm N$ in MCSCF approach”, Матем. биология и биоинформ., 6:1 (2011), 23–38
Образцы ссылок на эту страницу:
https://www.mathnet.ru/rus/mbb63 https://www.mathnet.ru/rus/mbb/v6/i1/p23
|
Статистика просмотров: |
Страница аннотации: | 244 | PDF полного текста: | 63 | Список литературы: | 40 | Первая страница: | 1 |
|