|
Математическая биология и биоинформатика, 2010, том 5, выпуск 2, страницы 202–214
(Mi mbb55)
|
|
|
|
Эта публикация цитируется в 1 научной статье (всего в 1 статье)
Математическое моделирование
Метод псевдосредних функций в теории RISM. Температурная зависимость гидратации пептида окситоцина
Д. А. Тихонов, Е. В. Соболев Институт математических проблем биологии РАН
Аннотация:
Выполнены молекулярно-динамические расчеты пептида окситоцина в диапазоне температур от 280 до 340 К в различных окружениях, включая явный водный растворитель. По полученным геометрическим конфигурациям пептида вычисляли энергию Гиббса, решая уравнения RISM для псевдосредних корреляционных функций, и сравнивали различные функционалы энергии Гиббса или избыточного химического потенциала. В приближении гауссовых флуктуаций и в теории парциальных волн энергия Гиббса не зависит от температуры. Расчеты по формуле Сингера–Чандлера или ее модификациям, учитывающим отталкивательные поправки, указывают на линейную зависимость энергии Гиббса от температуры. Анализ показывает, что температурная зависимость обусловлена членом, пропорциональным квадрату полной корреляционной функции.
Ключевые слова:
RISM, псевдосредние корреляционные функции, термодинамика, температурная зависимость, интегральные уравнения теории жидкостей.
Материал поступил в редакцию 01.12.2010, опубликован 17.12.2010
Образец цитирования:
Д. А. Тихонов, Е. В. Соболев, “Метод псевдосредних функций в теории RISM. Температурная зависимость гидратации пептида окситоцина”, Матем. биология и биоинформ., 5:2 (2010), 202–214
Образцы ссылок на эту страницу:
https://www.mathnet.ru/rus/mbb55 https://www.mathnet.ru/rus/mbb/v5/i2/p202
|
Статистика просмотров: |
Страница аннотации: | 275 | PDF полного текста: | 84 | Список литературы: | 52 | Первая страница: | 1 |
|