Математическая биология и биоинформатика
RUS  ENG    ЖУРНАЛЫ   ПЕРСОНАЛИИ   ОРГАНИЗАЦИИ   КОНФЕРЕНЦИИ   СЕМИНАРЫ   ВИДЕОТЕКА   ПАКЕТ AMSBIB  
Общая информация
Последний выпуск
Архив
Импакт-фактор

Поиск публикаций
Поиск ссылок

RSS
Последний выпуск
Текущие выпуски
Архивные выпуски
Что такое RSS



Матем. биология и биоинформ.:
Год:
Том:
Выпуск:
Страница:
Найти






Персональный вход:
Логин:
Пароль:
Запомнить пароль
Войти
Забыли пароль?
Регистрация


Математическая биология и биоинформатика, 2023, том 18, выпуск 1, страницы 33–48
DOI: https://doi.org/10.17537/2023.18.33
(Mi mbb507)
 

Математическое моделирование

Proton reaction path in base pairs of DNA molecule according to the Complete Active Space Self-Consistent Field method

K. V. Simona, A. V. Tulubb

a Ioffe Institute, St. Petersburg, Russia
b Saint Petersburg State University, Russia
Список литературы:
Аннотация: The double proton transfer reaction paths in AT and CG base pairs of DNA molecule are calculated in the Complete Active Space Self-Consistent Field method and compared with the same paths in Density Functional Theory with B3LYP approximation approach. We found that an essential increase of an activation energy, which significantly reduces the probability of spontaneous mutations in DNA via double proton transfer. There exist two transition points on the singlet potential energy surface divided by a flat region for GC base pair. The applicability of various quantum-chemical methods for description of double proton transfer reactions was discussed.
Ключевые слова: proton transfer, DNA, base pairs, ab initio CASSCF method.
Финансовая поддержка Номер гранта
Министерство науки и высшего образования Российской Федерации 0040-2019-0023
This work was performed in the framework of the Program of State Orders, project no. 0040-2019-0023.
Материал поступил в редакцию 08.02.2023, 20.02.2023, опубликован 26.02.2023
Тип публикации: Статья
Язык публикации: английский
Образец цитирования: K. V. Simon, A. V. Tulub, “Proton reaction path in base pairs of DNA molecule according to the Complete Active Space Self-Consistent Field method”, Матем. биология и биоинформ., 18:1 (2023), 33–48
Цитирование в формате AMSBIB
\RBibitem{SimTul23}
\by K.~V.~Simon, A.~V.~Tulub
\paper Proton reaction path in base pairs of DNA molecule according to the Complete Active Space Self-Consistent Field method
\jour Матем. биология и биоинформ.
\yr 2023
\vol 18
\issue 1
\pages 33--48
\mathnet{http://mi.mathnet.ru/mbb507}
\crossref{https://doi.org/10.17537/2023.18.33}
Образцы ссылок на эту страницу:
  • https://www.mathnet.ru/rus/mbb507
  • https://www.mathnet.ru/rus/mbb/v18/i1/p33
  • Citing articles in Google Scholar: Russian citations, English citations
    Related articles in Google Scholar: Russian articles, English articles
     
      Обратная связь:
     Пользовательское соглашение  Регистрация посетителей портала  Логотипы © Математический институт им. В. А. Стеклова РАН, 2024