|
Биоинформатика
Дизайн и идентификация потенциальных ингибиторов проникновения ВИЧ-1 методами in silico клик-химии и молекулярного моделирования
А. М. Андриановa, А. М. Юшкевичb, И. П. Боськоb, А. Д. Карпенкоb, Ю. В. Корноушенкоa, К. В. Фурсb, А. В. Тузиковb a Институт биоорганической химии НАН Беларуси, Минск, Республика Беларусь
b Объединенный институт проблем информатики НАН Беларуси, Минск, Республика Беларусь
Аннотация:
С помощью комплексного подхода, включающего методологию клик-химии, молекулярный докинг, квантовую механику и молекулярную динамику, осуществлен компьютерный дизайн потенциальных ингибиторов ВИЧ-1, способных блокировать мембрано-проксимальную внешнюю область белка gp41, играющую важную роль в процессе слияния мембран вируса и клетки хозяина. Методами молекулярного моделирования выполнена оценка эффективности связывания сконструированных соединений с пептидом MPER ВИЧ-1, в результате которой идентифицированы девять химических соединений, характеризующихся высокой аффинностью связывания с этим функционально важным участком оболочки вируса. Полученные данные свидетельствуют о перспективности использования этих соединений в работах по созданию новых противовирусных препаратов – ингибиторов слияния ВИЧ, блокирующих ранние стадии развития ВИЧ инфекции.
Ключевые слова:
ВИЧ-1, белок gp41, мембрано-проксимальная внешняя область, ингибиторы слияния ВИЧ, клик-химия, молекулярное моделирование, противовирусные препараты.
Материал поступил в редакцию 27.08.2021, 22.09.2021, опубликован 02.10.2021
Образец цитирования:
А. М. Андрианов, А. М. Юшкевич, И. П. Босько, А. Д. Карпенко, Ю. В. Корноушенко, К. В. Фурс, А. В. Тузиков, “Дизайн и идентификация потенциальных ингибиторов проникновения ВИЧ-1 методами in silico клик-химии и молекулярного моделирования”, Матем. биология и биоинформ., 16:2 (2021), 317–334
Образцы ссылок на эту страницу:
https://www.mathnet.ru/rus/mbb469 https://www.mathnet.ru/rus/mbb/v16/i2/p317
|
|