Математическая биология и биоинформатика
RUS  ENG    ЖУРНАЛЫ   ПЕРСОНАЛИИ   ОРГАНИЗАЦИИ   КОНФЕРЕНЦИИ   СЕМИНАРЫ   ВИДЕОТЕКА   ПАКЕТ AMSBIB  
Общая информация
Последний выпуск
Архив
Импакт-фактор

Поиск публикаций
Поиск ссылок

RSS
Последний выпуск
Текущие выпуски
Архивные выпуски
Что такое RSS



Матем. биология и биоинформ.:
Год:
Том:
Выпуск:
Страница:
Найти






Персональный вход:
Логин:
Пароль:
Запомнить пароль
Войти
Забыли пароль?
Регистрация


Математическая биология и биоинформатика, 2020, том 15, выпуск 1, страницы 93–105
DOI: https://doi.org/10.17537/2020.15.93
(Mi mbb424)
 

Эта публикация цитируется в 1 научной статье (всего в 1 статье)

Математическое моделирование

Исследование бризерной динамики ДНК в модели с нелокальной связью между нуклеотидными парами

Е. И. Гераськинa, В. Д. Лахноb, А. П. Четвериковa, А. С. Шигаевb

a Саратовский национальный исследовательский государственный университет им. Н. Г. Чернышевского, Саратов, Россия
b Институт математических проблем биологии РАН – филиал ИПМ имени М.В. Келдыша РАН, Пущино, Россия
Список литературы:
Аннотация: Предложен вариант модели Пейярда–Бишопа–Доксуа, в котором учтён частично делокализованный характер стэкинг-взаимодействий ДНК. Показано, что нелокальный inter-site потенциал способен приводить к повышению локальной кооперативности открывания баббла и увеличению числа синхронно открывающихся смежных нуклеотидных пар при его зарождении. Изучен процесс формирования и распространения мобильных бризеров, возбуждаемых за счет начальных смещений нескольких нуклеотидных пар. Установлено, что учет в модели ПБД нелокальной связи приводит, при сохранении остальных параметров модели, к уменьшению скорости мобильного бризера и повышению вероятности нуклеации пузырька денатурации.
Ключевые слова: ДНК, мобильный бризер, стэкинг-взамодействия, баббл, нуклеация, модель Пейярда–Бишопа–Доксуа.
Финансовая поддержка Номер гранта
Российский научный фонд 16-11-10163
Российский фонд фундаментальных исследований 19-07-00406-«а»
Работа выполнена при поддержке Российского научного фонда (проект РНФ № 16-11-10163) и Российского фонда фундаментальных исследований (проект РФФИ № 19-07-00406-«а»).
Материал поступил в редакцию 02.04.2020, 27.05.2020, опубликован 10.06.2020
Тип публикации: Статья
Образец цитирования: Е. И. Гераськин, В. Д. Лахно, А. П. Четвериков, А. С. Шигаев, “Исследование бризерной динамики ДНК в модели с нелокальной связью между нуклеотидными парами”, Матем. биология и биоинформ., 15:1 (2020), 93–105
Цитирование в формате AMSBIB
\RBibitem{GerLakChe20}
\by Е.~И.~Гераськин, В.~Д.~Лахно, А.~П.~Четвериков, А.~С.~Шигаев
\paper Исследование бризерной динамики ДНК в модели с нелокальной связью между нуклеотидными парами
\jour Матем. биология и биоинформ.
\yr 2020
\vol 15
\issue 1
\pages 93--105
\mathnet{http://mi.mathnet.ru/mbb424}
\crossref{https://doi.org/10.17537/2020.15.93}
Образцы ссылок на эту страницу:
  • https://www.mathnet.ru/rus/mbb424
  • https://www.mathnet.ru/rus/mbb/v15/i1/p93
  • Эта публикация цитируется в следующих 1 статьяx:
    Citing articles in Google Scholar: Russian citations, English citations
    Related articles in Google Scholar: Russian articles, English articles
    Статистика просмотров:
    Страница аннотации:152
    PDF полного текста:49
    Список литературы:18
     
      Обратная связь:
     Пользовательское соглашение  Регистрация посетителей портала  Логотипы © Математический институт им. В. А. Стеклова РАН, 2024