Математическая биология и биоинформатика
RUS  ENG    ЖУРНАЛЫ   ПЕРСОНАЛИИ   ОРГАНИЗАЦИИ   КОНФЕРЕНЦИИ   СЕМИНАРЫ   ВИДЕОТЕКА   ПАКЕТ AMSBIB  
Общая информация
Последний выпуск
Архив
Импакт-фактор

Поиск публикаций
Поиск ссылок

RSS
Последний выпуск
Текущие выпуски
Архивные выпуски
Что такое RSS



Матем. биология и биоинформ.:
Год:
Том:
Выпуск:
Страница:
Найти






Персональный вход:
Логин:
Пароль:
Запомнить пароль
Войти
Забыли пароль?
Регистрация


Математическая биология и биоинформатика, 2019, том 14, выпуск 2, страницы 612–624
DOI: https://doi.org/10.17537/2019.14.612
(Mi mbb406)
 

Эта публикация цитируется в 2 научных статьях (всего в 2 статьях)

Математическое моделирование

Математическое моделирование учета открытых состояний в зависимости от $^2$H/$^1$H соотношения в двухцепочечной молекуле ДНК

С. С. Джимакab, М. И. Дроботенкоab, А. А. Басовac, А. А. Свидловb, М. Г. Барышевab

a Кубанский государственный университет, Краснодар, Россия
b Южный научный центр РАН, Ростов-на-Дону, Россия
c Кубанский государственный медицинский университет, г. Краснодар
Список литературы:
Аннотация: В статье представлены результаты оценки возможного влияния атомов дейтерия на раскрытие пар азотистых оснований молекулы ДНК, причиной которого может быть изотопный обмен $^2$H/$^1$H, вследствие чего происходит увеличение энергии, необходимой для разрыва водородной связи. Эти процессы изучаются с помощью математического моделирования, учитывающего количество открытых состояний между парами оснований, что является одним из ключевых условий адекватности математической модели ДНК. Данные математического эксперимента показали, что присутствие дейтерия в цепочке нуклеотидов может вызывать в зависимости от величины энергии разрыва водородной связи как увеличение, так и уменьшение вероятности возникновения открытых состояний. Так, в рассмотренном примере при энергии разрыва водородной связи 0:358$\cdot$10$^{-22}$ Н$\cdot$м, наблюдается в случае отсутствия дейтерия в молекуле ненулевая вероятность появления открытых состояний, а с энергией разрыва водородной связи 0:359$\cdot$10$^{-22}$ Н$\cdot$м или более такая вероятность равна нулю. Если же в молекуле присутствует один атом дейтерия, ненулевая вероятность наблюдается даже при энергии разрыва водородной связи равной 0:368$\cdot$10$^{-22}$ Н$\cdot$м (то есть более 0:358$\cdot$10$^{-22}$ Н$\cdot$м). Показано, что участие атомов дейтерия в образовании водородных связей двойных спиралей молекулы ДНК может вызвать изменения во времени, необходимом для передачи генетической информации, что может объяснить влияние даже незначительных отклонений концентрации дейтерия в среде на метаболические процессы в живых системах.
Ключевые слова: ДНК, дейтерий, вращательные движения азотистых оснований, молекулярная динамика двухцепочечной ДНК, открытые состояния.
Финансовая поддержка Номер гранта
Министерство образования и науки Российской Федерации МК-3359.2017.4
АААА-А19-119040390083-6
Российский фонд фундаментальных исследований 19-44-230026
Работа выполнена при финансовой поддержке гранта Президента Российской Федерации для государственной поддержки молодых российских ученых МК-3359.2017.4, Российского фонда фундаментальных исследований, проект № 19-44-230026 и государственного задания ЮНЦ РАН (№ АААА-А19-119040390083-6).
Материал поступил в редакцию 24.09.2019, 10.12.2019, опубликован 11.12.2019
Тип публикации: Статья
УДК: 577.323.36: 51-76
Образец цитирования: С. С. Джимак, М. И. Дроботенко, А. А. Басов, А. А. Свидлов, М. Г. Барышев, “Математическое моделирование учета открытых состояний в зависимости от $^2$H/$^1$H соотношения в двухцепочечной молекуле ДНК”, Матем. биология и биоинформ., 14:2 (2019), 612–624
Цитирование в формате AMSBIB
\RBibitem{DzhDroBas19}
\by С.~С.~Джимак, М.~И.~Дроботенко, А.~А.~Басов, А.~А.~Свидлов, М.~Г.~Барышев
\paper Математическое моделирование учета открытых состояний в зависимости от $^2$H/$^1$H соотношения в двухцепочечной молекуле ДНК
\jour Матем. биология и биоинформ.
\yr 2019
\vol 14
\issue 2
\pages 612--624
\mathnet{http://mi.mathnet.ru/mbb406}
\crossref{https://doi.org/10.17537/2019.14.612}
Образцы ссылок на эту страницу:
  • https://www.mathnet.ru/rus/mbb406
  • https://www.mathnet.ru/rus/mbb/v14/i2/p612
  • Эта публикация цитируется в следующих 2 статьяx:
    Citing articles in Google Scholar: Russian citations, English citations
    Related articles in Google Scholar: Russian articles, English articles
     
      Обратная связь:
     Пользовательское соглашение  Регистрация посетителей портала  Логотипы © Математический институт им. В. А. Стеклова РАН, 2024