Математическая биология и биоинформатика
RUS  ENG    ЖУРНАЛЫ   ПЕРСОНАЛИИ   ОРГАНИЗАЦИИ   КОНФЕРЕНЦИИ   СЕМИНАРЫ   ВИДЕОТЕКА   ПАКЕТ AMSBIB  
Общая информация
Последний выпуск
Архив
Импакт-фактор

Поиск публикаций
Поиск ссылок

RSS
Последний выпуск
Текущие выпуски
Архивные выпуски
Что такое RSS



Матем. биология и биоинформ.:
Год:
Том:
Выпуск:
Страница:
Найти






Персональный вход:
Логин:
Пароль:
Запомнить пароль
Войти
Забыли пароль?
Регистрация


Математическая биология и биоинформатика, 2019, том 14, выпуск 2, страницы 406–419
DOI: https://doi.org/10.17537/2019.14.406
(Mi mbb392)
 

Эта публикация цитируется в 10 научных статьях (всего в 10 статьях)

Математическое моделирование

Динамика полярона большого радиуса в модельной полинуклеотидной цепочке со случайными возмущениями

Н. С. Фиалко, В. Д. Лахно

Институт математических проблем биологии РАН – филиал Федерального государственного учреждения "Федеральный исследовательский центр Институт прикладной математики им. М.В. Келдыша Российской академии наук", Пущино, Московская область, Россия
Список литературы:
Аннотация: В работе с помощью вычислительного эксперимента исследована динамика полярона в цепочке с учетом температуры, которая имитируется случайными возмущениями ланжевеновского типа, и под действием постоянного электрического поля. В достаточно длинной невозмущенной цепочке смещение центра масс полярона и его скорость не зависит от ее длины. В полуклассической модели Холстейна, используемой для моделирования переноса заряда в ДНК, область существования поляронов в термодинамически равновесном состоянии зависит не только от температуры, но и от длины цепочки. Поэтому при моделировании из поляронных начальных данных временные зависимости среднего смещения центра масс заряда при одинаковой температуре различны для цепочек разной длины. По результатам вычислительного эксперимента, для полярона большого радиуса временная зависимость “среднего смещения полярона”, которая учитывает только пик полярона и его положение, для цепочек разной длины ведет себя одинаково на временах, пока полярон не разрушается. Одинаковый угол наклона смещения полярона позволяет найти среднюю скорость полярона. Проведенные расчеты позволяют предположить, что в модели Холстейна при нулевой температуре подвижность полярона большого радиуса маленькая, но ненулевая.
Ключевые слова: модель Холстейна, термостат Ланжевена, ДНК, заряд, напряженность, смещение центра масс заряда, смещение полярона.
Материал поступил в редакцию 27.05.2019, 29.06.2019, опубликован 16.07.2019
Тип публикации: Статья
УДК: 51-7, 53.09
Образец цитирования: Н. С. Фиалко, В. Д. Лахно, “Динамика полярона большого радиуса в модельной полинуклеотидной цепочке со случайными возмущениями”, Матем. биология и биоинформ., 14:2 (2019), 406–419
Цитирование в формате AMSBIB
\RBibitem{FiaLak19}
\by Н.~С.~Фиалко, В.~Д.~Лахно
\paper Динамика полярона большого радиуса в модельной полинуклеотидной цепочке со случайными возмущениями
\jour Матем. биология и биоинформ.
\yr 2019
\vol 14
\issue 2
\pages 406--419
\mathnet{http://mi.mathnet.ru/mbb392}
\crossref{https://doi.org/10.17537/2019.14.406}
Образцы ссылок на эту страницу:
  • https://www.mathnet.ru/rus/mbb392
  • https://www.mathnet.ru/rus/mbb/v14/i2/p406
  • Эта публикация цитируется в следующих 10 статьяx:
    Citing articles in Google Scholar: Russian citations, English citations
    Related articles in Google Scholar: Russian articles, English articles
    Статистика просмотров:
    Страница аннотации:130
    PDF полного текста:35
    Список литературы:19
     
      Обратная связь:
     Пользовательское соглашение  Регистрация посетителей портала  Логотипы © Математический институт им. В. А. Стеклова РАН, 2024