|
Эта публикация цитируется в 2 научных статьях (всего в 2 статьях)
Математическое моделирование
Исследование фотоизомеризации хромофора родопсина на основе квантово-классической модели
А. С. Шигаевa, Т. Б. Фельдманb, В. А. Надточенкоc, М. А. Островскийb, В. Д. Лахноa a Институт математических проблем биологии РАН – филиал ИПМ им. М.В. Келдыша РАН, Пущино, Россия
b Институт биохимической физики им. Н.М. Эмануэля РАН, Москва, Россия
c Институт химической физики им. Н.Н. Семенова РАН, Москва, Россия
Аннотация:
Квантово-классическая модель цис-транс фотоизомеризации родопсинового хромофора (ретиналя) исследована в широких диапазонах параметров. Квантовая подсистема модели включает три электронных состояния родопсина: основное состояние, возбуждённое состояние и основное состояние первичного фотопродукта. В качестве важнейшей контрольной величины использована локальная температура точечных масс классической подсистемы модели. Обнаружено, что наиболее близкое соответствие поведения модели многочисленным экспериментальным данным наблюдается в диапазоне умеренных температур, согласующихся с данными Рамановской спектроскопии. Показана важная роль быстрой передачи избыточной энергии фотовозбуждения в апоферментную часть белка в стабилизации первичного фотопродукта. Путём численных исследований модели доказан элементарный характер фотоизомеризации хромофора и узкая локализация смещений атомных групп ретиналя.
Ключевые слова:
родопсин, ретиналь, хромофор, цис-транс фотоизомеризация, квантово-классическая модель.
Материал поступил в редакцию 30.03.2018, опубликован 25.05.2018
Образец цитирования:
А. С. Шигаев, Т. Б. Фельдман, В. А. Надточенко, М. А. Островский, В. Д. Лахно, “Исследование фотоизомеризации хромофора родопсина на основе квантово-классической модели”, Матем. биология и биоинформ., 13:1 (2018), 169–186
Образцы ссылок на эту страницу:
https://www.mathnet.ru/rus/mbb332 https://www.mathnet.ru/rus/mbb/v13/i1/p169
|
Статистика просмотров: |
Страница аннотации: | 234 | PDF полного текста: | 79 | Список литературы: | 32 |
|