|
Эта публикация цитируется в 2 научных статьях (всего в 2 статьях)
Интеллектуальный анализ данных
Сравнительный анализ подходов к классификации дифракционных изображений биологических частиц, получаемых в экспериментах по когерентной рентгеновской дифракционной микроскопии
С. А. Бобков Национальный исследовательский центр “Курчатовский Институт”, Москва, Россия
Аннотация:
Метод когерентной рентгеновской дифракционной микроскопии дает возможность определения трехмерной структуры наноразмерных объектов, в том числе таких биологических частиц, как белки и вирусы, с разрешением до 1 Å. В таких экспериментах излучение лазера на свободных электронах рассеивается на изучаемых объектах. На основе собранных дифракционных изображений можно определить исходную структуру объекта. Однако далеко не все дифракционные изображения, получаемые в экспериментах, подходят для восстановления структуры. Большинство изображений бывают пустыми, многие изображения относится к частицам примеси, другие содержат дифракционную картину от нескольких частиц. Таким образом, классификация изображений по типу структуры становится важным этапом первичной обработки данных. В работе сравниваются несколько подходов к классификации изображений по типу структуры. Сравнение проведено на разных наборах экспериментальных данных. В 2017 году начал работу новый лазер на свободных электронах European XFEL, который позволит регистрировать до 27000 дифракционных изображений в секунду. В статье представлены результаты исследования возможности применения разных подходов для классификации изображений в экспериментах на European XFEL в потоковом режиме.
Ключевые слова:
когерентная рентгеновская дифракционная микроскопия, биологические частицы, корреляционные коэффициенты, метод опорных векторов, метод к-средних, метод спектральной кластеризации, многослойный перцептрон, свёрточная нейронная сеть.
Материал поступил в редакцию 01.11.2017, опубликован 29.11.2017
Образец цитирования:
С. А. Бобков, “Сравнительный анализ подходов к классификации дифракционных изображений биологических частиц, получаемых в экспериментах по когерентной рентгеновской дифракционной микроскопии”, Матем. биология и биоинформ., 12:2 (2017), 411–434
Образцы ссылок на эту страницу:
https://www.mathnet.ru/rus/mbb303 https://www.mathnet.ru/rus/mbb/v12/i2/p411
|
Статистика просмотров: |
Страница аннотации: | 260 | PDF полного текста: | 60 | Список литературы: | 32 |
|