|
Эта публикация цитируется в 1 научной статье (всего в 1 статье)
Биоинформатика
Структурно-статистические свойства геномов флавивирусов
Ж. С. Тюлькоa, В. А. Кутыркинb, М. Б. Чалейc a ОмГМУ Минздрава России, Омск, 644099, Россия
b МГТУ им. Н.Э. Баумана, Москва, 107005, Россия
c ИМПБ РАН – филиал ИПМ им. М.В. Келдыша РАН, Пущино, Московская область, 142290, Россия
Аннотация:
На основе спектрально-статистического подхода исследуются основные структурно-статистические свойства кодирующих районов из геномов флавивирусов. Анализируются как полноразмерные кодирующие районы полипротеинов, так и их отдельные структурные сегменты. Показано, что структурно-статистические свойства геномных последовательностей флавивирусов, в целом, аналогичны выявленным ранее свойствам 3-регулярности и скрытой триплетной профильности в кодирующих районах геномов прокариот и эукариот. С другой стороны, в отдельных, кодирующих белки, структурных сегментах из геномов флавивирусов полностью отсутствует двухуровневая организация кодирования, и в их значительной части проявляется свойство однородности последовательности. Такие особенности кодирующих районов флавивирусов объясняются простой структурой и высокой скоростью мутаций их геномов.
Ключевые слова:
геном флавивирусов, геном прокариот, геном эукариот, спектрально-статистический подход, скрытая профильная периодичность, свойство 3-регулярности.
Материал поступил в редакцию 08.09.2017, опубликован 12.10.2017
Образец цитирования:
Ж. С. Тюлько, В. А. Кутыркин, М. Б. Чалей, “Структурно-статистические свойства геномов флавивирусов”, Матем. биология и биоинформ., 12:2 (2017), 343–353
Образцы ссылок на эту страницу:
https://www.mathnet.ru/rus/mbb298 https://www.mathnet.ru/rus/mbb/v12/i2/p343
|
Статистика просмотров: |
Страница аннотации: | 216 | PDF полного текста: | 50 | Список литературы: | 30 |
|