Аннотация:
На основе модели Пейрарда–Бишопа–Холстейна проведены численные эксперименты, демонстрирующие возможность переноса заряда поляронами в однородной незамкнутой G/C цепочке ДНК за счёт взаимодействия с локализованными возбуждениями при отсутствии электрического поля в цепочке. Показано, что, в зависимости от параметров выбранных начальных возбуждений и от параметров цепочки, полярон может двигаться на большие расстояния (около тысячи сайтов). Показано также, что способность полярона двигаться и характер этого движения в значительной степени зависят от взаимного расположения полярона и выбранных локализованных возбуждений.
Ключевые слова:
ДНК, нанобиоэлектроника, полярон, модель Пейрарда–Бишопа–Холстейна, подвижность.
Работа поддержана грантами РФФИ №16-07-00305, РНФ №16-11-10163.
Материал поступил в редакцию 27.04.2017, опубликован 05.06.2017
Тип публикации:
Статья
УДК:519.6, 51-7
Образец цитирования:
А. Н. Коршунова, В. Д. Лахно, “Особенности движения полярона в молекулярных полинуклеотидных цепочках конечной длины при наличии в цепочке локализованных возбуждений”, Матем. биология и биоинформ., 12:1 (2017), 204–224
\RBibitem{KorLak17}
\by А.~Н.~Коршунова, В.~Д.~Лахно
\paper Особенности движения полярона в молекулярных полинуклеотидных цепочках конечной длины при наличии в~цепочке локализованных возбуждений
\jour Матем. биология и биоинформ.
\yr 2017
\vol 12
\issue 1
\pages 204--224
\mathnet{http://mi.mathnet.ru/mbb290}
\crossref{https://doi.org/10.17537/2017.12.204}
Образцы ссылок на эту страницу:
https://www.mathnet.ru/rus/mbb290
https://www.mathnet.ru/rus/mbb/v12/i1/p204
Эта публикация цитируется в следующих 11 статьяx:
Г. А. Виноградов, “Взаимодействие полярона с ловушкой. Влияние адиабатичности”, Матем. биология и биоинформ., 17:1 (2022), 28–42 [G. A. Vinogradov, “Interaction of a polaron with a trap. Influence of adiabaticity”, Mat. Biolog. Bioinform., 17:1 (2022), 28–42]
А. Н. Коршунова, В. Д. Лахно, “Зависимость движения заряда в постоянном электрическом поле в полинуклеотидных цепочках от значения константы связи заряда со смещениями цепочки”, Матем. биология и биоинформ., 17, Suppl. (2022), 1–13
A. N. Korshounova, V. D. Lakhno, “Charge motion along polynucleotide chains in a constant electric field depends on the charge coupling constant with chain displacements”, Матем. биология и биоинформ., 16:2 (2021), 411–421
Korshunova A.N. Lakhno V.D., “Charge Transfer By Polarons in a Homogeneouspoly G/Poly C-Chain Subjected to a Constant Electric Field in Terms of the Peyrard-Bishop-Holstein Model”, Tech. Phys., 65:9 (2020), 1467–1474
Li L., Cai Z., “Flame-Retardant Performance of Transparent and Tensile-Strength-Enhanced Epoxy Resins”, Polymers, 12:2 (2020), 317
A.N. Korshunova, V.D. Lakhno, Proceedings of the International Conference “Mathematical Biology and Bioinformatics”, 8, Proceedings of the International Conference “Mathematical Biology and Bioinformatics”, 2020
А. Н. Коршунова, В. Д. Лахно, “Моделирование стационарных и нестационарных режимов движения заряда в однородной холстейновской цепочке в постоянном электрическом поле”, Препринты ИПМ им. М. В. Келдыша, 2018, 028, 18 с.
А. Н. Коршунова, В. Д. Лахно, “Быстрое формирование движущегося поляронного состояния в однородной молекулярной полинуклеотидной цепочке конечной длины”, Препринты ИПМ им. М. В. Келдыша, 2018, 231, 22 с.
А. Н. Коршунова, В. Д. Лахно, “Особенности движения заряда в однородных молекулярных полинуклеотидных цепочках конечной длины. Быстрое формирование движущегося поляронного состояния”, Матем. биология и биоинформ., 13:2 (2018), 534–550
А. Н. Коршунова, В. Д. Лахно, “Моделирование стационарных и нестационарных режимов движения заряда в однородной холстейновской цепочке в постоянном электрическом поле”, ЖТФ, 88:9 (2018), 1312–1319; A. N. Korshounova, V. D. Lakhno, “Simulation of the stationary and nonstationary charge transfer conditions in a uniform Holstein chain placed in constant electric field”, Tech. Phys., 63:9 (2018), 1270–1276
A.N. Korshunova, V.D. Lakhno, Proceedings of the International Conference “Mathematical Biology and Bioinformatics”, 7, Proceedings of the International Conference “Mathematical Biology and Bioinformatics”, 2018