|
Математическое моделирование
Случайные блуждания по псевдоспецифическим состояниям как модель облегченной диффузии ДНК-связывающего белка
Р. Т. Сибатов, Ю. В. Саенко Ульяновский государственный университет
Аннотация:
Рассматривается облегченная диффузия регуляторного белка в процессе поиска специфического сайта-мишени на молекуле ДНК. На основе гипотезы о баллистическом движении между рассеяниями на псевдоспецифических участках предложена феноменологическая модель одномерного движения белка. Сочетание этого подхода с моделью дискретных случайных блужданий позволила получить зависимости среднего времени первого достижения от энергии связи, среднего пробега между псевдоспецифическими состояниями, скорости белка и температуры. Выявлены температурный и энергетический оптимумы, при которых достигаются минимальные значения среднего времени поиска.
Ключевые слова:
облегченная диффузия, фактор транскрипции, ДНК, случайное блуждание, время первого достижения.
Материал поступил в редакцию 11.09.2015, опубликован 30.11.2015
Образец цитирования:
Р. Т. Сибатов, Ю. В. Саенко, “Случайные блуждания по псевдоспецифическим состояниям как модель облегченной диффузии ДНК-связывающего белка”, Матем. биология и биоинформ., 10:2 (2015), 473–481
Образцы ссылок на эту страницу:
https://www.mathnet.ru/rus/mbb239 https://www.mathnet.ru/rus/mbb/v10/i2/p473
|
Статистика просмотров: |
Страница аннотации: | 215 | PDF полного текста: | 58 | Список литературы: | 44 | Первая страница: | 8 |
|