Аннотация:
Проведен виртуальный скрининг химических соединений, способных имитировать фармакофорные свойства моноклонального антитела 10Е8, проявляющего нейтрализующую активность против широкого набора вариантов ВИЧ-1. Методами докинга и молекулярной динамики выполнена оценка эффективности связывания найденных соединений с участком MPER (Membrane-Proximal External Region) белка gp41 ВИЧ-1, ответственным за слияние мембран вируса и клетки-мишени. Обнаружены восемь химических соединений, характеризующихся отрицательными значениями свободной энергии образования структурных комплексов с этим функционально важным участком ВИЧ. Полученные данные свидетельствуют о перспективности использования идентифицированных соединений в работах по созданию новых противовирусных препаратов — ингибиторов слияния ВИЧ, блокирующих участок MPER белка gp41.
Работа поддержана Белорусским республиканским фондом фундаментальных исследований (проект X15-022).
Материал поступил в редакцию 21.07.2015, опубликован 07.09.2015
Тип публикации:
Статья
УДК:
51-76:577.322:539.19
Образец цитирования:
И. А. Кашин, А. В. Тузиков, А. М. Андрианов, “Идентификация новых потенциальных ингибиторов белка gp41 ВИЧ-1 методами виртуального скрининга и молекулярного моделирования”, Матем. биология и биоинформ., 10:2 (2015), 325–343
\RBibitem{KasTuzAnd15}
\by И.~А.~Кашин, А.~В.~Тузиков, А.~М.~Андрианов
\paper Идентификация новых потенциальных ингибиторов белка gp41 ВИЧ-1 методами виртуального скрининга и молекулярного моделирования
\jour Матем. биология и биоинформ.
\yr 2015
\vol 10
\issue 2
\pages 325--343
\mathnet{http://mi.mathnet.ru/mbb229}
\crossref{https://doi.org/10.17537/2015.10.325}
Образцы ссылок на эту страницу:
https://www.mathnet.ru/rus/mbb229
https://www.mathnet.ru/rus/mbb/v10/i2/p325
Эта публикация цитируется в следующих 3 статьяx:
А. М. Андрианов, А. М. Юшкевич, И. П. Босько, А. Д. Карпенко, Ю. В. Корноушенко, К. В. Фурс, А. В. Тузиков, “Дизайн и идентификация потенциальных ингибиторов проникновения ВИЧ-1 методами in silico клик-химии и молекулярного моделирования”, Матем. биология и биоинформ., 16:2 (2021), 317–334
А. М. Андрианов, Г. И. Николаев, Ю. В. Корноушенко, Хуанг Дж., Дзян Ш., А. В. Тузиков, “In silico идентификация высокоаффинных лигандов белка gp120 ВИЧ-1 – потенциальных пептидомиметиков нейтрализующего антитела N6”, Матем. биология и биоинформ., 14:2 (2019), 430–449
А. М. Андрианов, Г. И. Николаев, И. А. Кашин, А. В. Тузиков, “Разработка потенциальных ингибиторов ВИЧ-1 методами in silico клик-химии и молекулярного моделирования”, Матем. биология и биоинформ., 13:2 (2018), 507–525
Цитирование в формате AMSBIB
Обратная связь: