Математическая биология и биоинформатика
RUS  ENG    ЖУРНАЛЫ   ПЕРСОНАЛИИ   ОРГАНИЗАЦИИ   КОНФЕРЕНЦИИ   СЕМИНАРЫ   ВИДЕОТЕКА   ПАКЕТ AMSBIB  
Общая информация
Последний выпуск
Архив
Импакт-фактор

Поиск публикаций
Поиск ссылок

RSS
Последний выпуск
Текущие выпуски
Архивные выпуски
Что такое RSS



Матем. биология и биоинформ.:
Год:
Том:
Выпуск:
Страница:
Найти






Персональный вход:
Логин:
Пароль:
Запомнить пароль
Войти
Забыли пароль?
Регистрация


Математическая биология и биоинформатика, 2013, том 8, выпуск 1, страницы 93–118 (Mi mbb136)  

Математическое моделирование

Компьютерное моделирование дифракции импульсов рентгеновских лучей на нанокристаллах биологических макромолекул с использованием унитарной аппроксимации нестационарных факторов атомного рассеяния

В. Ю. Лунинa, А. Н. Грум-Гржимайлоb, Е. В. Грызловаb, Д. О. Синицынc, Н. К. Балабаевa, Н. Л. Лунинаa, Т. Е. Петроваa, К. Б. Терешкинаc, Э. Г. Абдулнасыровc, А. С. Степановc, Ю. Ф. Крупянскийc

a Институт математических проблем биологии, Российская академия наук, Пущино, Московская область, 142290, Россия
b Научно-исследовательский институт ядерной физики имени Д. В. Скобельцына Московского государственного университета имени М. В. Ломоносова, Москва, 119991, Россия
c Институт химической физики им. Н. Н. Семенова РАН, Российская академия наук, Москва 119991, Россия
Список литературы:
Аннотация: Использование в процессе рентгеновского дифракционного эксперимента мощных импульсных источников может приводить к существенному изменению электронной структуры объекта за время действия импульса. Учет этих изменений существенно усложняет решение прямой задачи рентгеновского рассеяния — расчета дифракционной картины на основе имеющейся атомной модели исследуемого объекта. Нами предложены две упрощенные схемы, позволяющие проводить подобный расчет с использованием стандартных методов стационарной (предполагающей неизменность объекта в процессе эксперимента) биологической кристаллографии, оставаясь в рамках точности, достижимой на сегодняшний день при исследовании биологических макромолекул. Продемонстрировано, что при использовании импульсов умеренной интенсивности и работе с наборами экспериментальных данных среднего разрешения ослабление во времени интенсивности рассеянных лучей происходит почти синхронно для всех брэгговских рефлексов. Это позволяет проводить расчет картины рассеяния по стандартным формулам, адаптируя к эксперименту лишь общий масштабирующий коэффициент. Для работы с более мощными пучками предложена модификация стандартных расчетных формул, которая сводится к замене стандартных факторов атомного рассеяния (формфакторов) их эффективными аналогами, вычисляемыми на основе нестационарных формфакторов.
Ключевые слова: рентгеновский лазер на свободных электронах, фемтосекундные рентгеновские импульсы, рассеяние рентгеновских лучей, дифракция, нанокристаллы, биомакромолекулы.
Материал поступил в редакцию 11.03.2012, опубликован 19.03.2013
Тип публикации: Статья
УДК: 577.3
Образец цитирования: В. Ю. Лунин, А. Н. Грум-Гржимайло, Е. В. Грызлова, Д. О. Синицын, Н. К. Балабаев, Н. Л. Лунина, Т. Е. Петрова, К. Б. Терешкина, Э. Г. Абдулнасыров, А. С. Степанов, Ю. Ф. Крупянский, “Компьютерное моделирование дифракции импульсов рентгеновских лучей на нанокристаллах биологических макромолекул с использованием унитарной аппроксимации нестационарных факторов атомного рассеяния”, Матем. биология и биоинформ., 8:1 (2013), 93–118
Цитирование в формате AMSBIB
\RBibitem{LunGruGry13}
\by В.~Ю.~Лунин, А.~Н.~Грум-Гржимайло, Е.~В.~Грызлова, Д.~О.~Синицын, Н.~К.~Балабаев, Н.~Л.~Лунина, Т.~Е.~Петрова, К.~Б.~Терешкина, Э.~Г.~Абдулнасыров, А.~С.~Степанов, Ю.~Ф.~Крупянский
\paper Компьютерное моделирование дифракции импульсов рентгеновских лучей на нанокристаллах биологических макромолекул с использованием унитарной аппроксимации нестационарных факторов атомного рассеяния
\jour Матем. биология и биоинформ.
\yr 2013
\vol 8
\issue 1
\pages 93--118
\mathnet{http://mi.mathnet.ru/mbb136}
Образцы ссылок на эту страницу:
  • https://www.mathnet.ru/rus/mbb136
  • https://www.mathnet.ru/rus/mbb/v8/i1/p93
  • Citing articles in Google Scholar: Russian citations, English citations
    Related articles in Google Scholar: Russian articles, English articles
    Статистика просмотров:
    Страница аннотации:347
    PDF полного текста:99
    Список литературы:60
    Первая страница:1
     
      Обратная связь:
     Пользовательское соглашение  Регистрация посетителей портала  Логотипы © Математический институт им. В. А. Стеклова РАН, 2024