Клонирование генов / С. Н. Щелкунов; Отв. ред. В. В. Власов; АН СССР, Сиб. отд-ние, Новосиб. ин-т биоорган. химии. - Новосибирск : Наука : Сиб. отд-ние, 1986. - 225,[3] с. : ил.
Конструирование гибридных молекул ДНК / С. Н. Щелкунов ; отв. ред. В. В. Власов ; АН СССР, Сибирское отделение, Новосибирский институт биоорганической химии. - Новосибирск : Наука. Сибирское. отд-ние, 1987. - 166, [2] с. : ил.
Генетическая инженерия. Учеб. пос. для вузов по напр. "Биология" и спец. "Биотехнология", "Биохимия", "Генетика", "Микробиология". В 2 ч.). / С. Н. Щелкунов. Ч. 1. - Новосибирск : Изд-во Новосиб. ун-та, 1994. - 303 с. : ил. - ISBN 5-7615-0210-0
Н. В. Иванисенко, Т. В. Трегубчак, О. В. Сайк, В. А. Иванисенко, С. Н. Щелкунов, Н. А. Колчанов, “Молекулярные механизмы взаимодействия белков CrmB вируса оспы коров и вируса натуральной оспы с фактором некроза опухолей человека”, Матем. биология и биоинформ., 8:2 (2013), 467–479