Первоначально был создан в 1975 г. Отдел математических методов автоматизации научных исследований и проектирования) на базе Отдела математических методов и вычислительной техники Института леса Карельского филиала АН СССР как самостоятельное научное подразделение с правами института. В его составе было 4 лаборатории с численностью 43 человека.

Исследования и разработки Отдела проводились по двум основным направлениям:

1. автоматизация научных исследований в подразделениях КФ АН СССР;
2. автоматизация проектирования транспортных коммуникаций и мелиоративных систем.


В 1992 г. постановлением Президиума КарНЦ РАН и  в соответствии с рекомендациями Отделения математики отдел был переименован в Отдел математики и анализа данных. Область научных исследований была расширена:


3. системные изучения природных, социальных и производственных комплексов Карелии, разработка математических и информационных моделей для решения научно-технических и экологических задач оптимального управления этими комплексами;
4. изучение проблем развития топливно-энергетического комплекса Республики Карелия.

• Карельский научный центр РАН