Научно-исследовательские учреждения Карельского научного центра РАН:

1. Институт биологии,
2. Институт водных проблем Севера,
3. Институт геологии,
4. Институт леса,
5. Институт прикладных математических исследований,
6. Институт экономики,
7. Институт языка, литературы и истории.

1. Редакционно-издательский отдел,
2. Научная библиотека,
3. Патентная служба,
4. Научный архив,
5. Редакция энциклопедии "Карелия",
6. Валаамский стационар,
7. Информационная служба,
8. Группа переводчиков и преподавателей по подготовке аспирантов,
9. Служба по охране труда.

• Отдел комплексных научных исследований Федерального государственного бюджетного учреждения науки Федерального исследовательского центра "Карельский научный центр Российской академии наук"
• Институт прикладных математических исследований Карельского научного центра Российской академии наук
• Институт экономики Карельского научного центра Российской академии наук