|
Прикладная математика
Автоматическое получение «упрощенной лейкоцитарной формулы» методами проточной цитофлуориметрии и кластерного анализа
А. В. Орехов, В. И. Шишкин, Г. В. Кудрявцева, Г. В. Павилайнен, В. В. Шишкин, Н. С. Людкевич Санкт-Петербургский государственный университет, Российская Федерация, 199034, Санкт-Петербург, Университетская наб., 7–9
Аннотация:
Лейкоцитарная формула — это процентное отношение основных групп белых клеток крови (лейкоцитов). По морфологическим признакам среди лейкоцитов можно выделить три субпопуляции: лимфоциты, моноциты и гранулоциты, последние разделяют на нейтрофильные, эозинофильные и базофильные клетки. Автоматическая типологизация белых клеток крови является нерешенной задачей, поэтому при их цитометрическом исследовании подсчет количества клеток в различных субпопуляциях лейкоцитов фактически производится вручную, что, в свою очередь, обусловливает субъективность эксперимента и большие значения погрешностей при вычислениях. Для решения проблемы автоматической типологизации белых клеток крови предпринимались попытки использования методов кластерного анализа. В вычислительных экспериментах было показано, что применение стандартных алгоритмов, таких как метод К-средних, EM-алгоритм, DBSCAN и т. п., не эффективно. За последние годы опубликовано большое количество исследовательских работ, в которых описываются специализированные алгоритмы кластеризации для обнаружения и определения субпопуляций белых клеток крови, некоторые из них нашли практическое применение, но по-прежнему актуальными остаются проблемы, связанные с наличием значительного количества шумов и с различной плотностью распределения данных при кластеризации лейкоцитов методами проточной цитометрии. Рассматривается подход к построению стратегии автоматического выделения лимфоцитов, моноцитов и гранулоцитов при помощи модифицированного агломеративного центроидного метода кластеризации. Обсуждаются результаты вычислительных экспериментов.
Ключевые слова:
лейкоцитарная формула, проточная цитометрия, кластерный анализ, марковский момент, метод наименьших квадратов.
Поступила: 27 мая 2023 г. Принята к печати: 12 октября 2023 г.
Образец цитирования:
А. В. Орехов, В. И. Шишкин, Г. В. Кудрявцева, Г. В. Павилайнен, В. В. Шишкин, Н. С. Людкевич, “Автоматическое получение «упрощенной лейкоцитарной формулы» методами проточной цитофлуориметрии и кластерного анализа”, Вестн. С.-Петербург. ун-та. Сер. 10. Прикл. матем. Информ. Проц. упр., 19:4 (2023), 469–483
Образцы ссылок на эту страницу:
https://www.mathnet.ru/rus/vspui596 https://www.mathnet.ru/rus/vspui/v19/i4/p469
|
Статистика просмотров: |
Страница аннотации: | 33 | PDF полного текста: | 21 | Список литературы: | 18 |
|