|
Вычислительные методы и программирование, 2018, том 19, выпуск 4, страницы 327–339
(Mi vmp923)
|
|
|
|
Моделирование деления биологических клеток в стадии метафазы на суперкомпьютере “Ломоносов-2”
М. А. Кривовa, А. В. Зайцевb, Ф. И. Атауллахановb, П. С. Ивановc a Московский государственный университет имени М. В. Ломоносова, факультет вычислительной математики и кибернетики
b Центр теоретических проблем физико-химической фармакологии РАН, Москва
c Физический факультет, Московский государственный университет имени М.В. Ломоносова
Аннотация:
Статья посвящена проблеме построения математической модели биологической клетки, описывающей процесс ее деления в рамках $M$-фазы. Рассмотрено предложенное авторами уточнение одной из известных моделей путем перехода с двумерного на трехмерный случай. Модифицированная модель реализована в виде универсального программного комплекса для моделирования деления клеток в стадиях прометафазы, метафазы и анафазы на локальных машинах и суперкомпьютерах. С его помощью на кластере “Ломоносов-2” изучено влияние размера активной области кинетохора на количество меротельных зацеплений в стадии метафазы. Показано, что наблюдаемая зависимость проявляется не столько из-за геометрических ограничений, как предполагалось ранее, сколько из-за больших углов разворота пар хромосом.
Ключевые слова:
митоз, метафаза, кинетохор, меротельные микротрубочки, математическое моделирование, суперкомпьютер.
Поступила в редакцию: 22.06.2018
Образец цитирования:
М. А. Кривов, А. В. Зайцев, Ф. И. Атауллаханов, П. С. Иванов, “Моделирование деления биологических клеток в стадии метафазы на суперкомпьютере “Ломоносов-2””, Выч. мет. программирование, 19:4 (2018), 327–339
Образцы ссылок на эту страницу:
https://www.mathnet.ru/rus/vmp923 https://www.mathnet.ru/rus/vmp/v19/i4/p327
|
|