The influence of urea on G-quadruplex and i-motif structures in complementary DNA sequences

В работе методами кругового дихроизма и УФ-/видимой спектрофотометрии исследовалось влияние мочевины на структурные переходы i-мотив $\leftrightarrows$ развернутая одиночная нить в d[3$^{\prime}$-(CCCAAT)$_{3}$CCC-5)$^{\prime}$] цитозин-богатом участке теломерной ДНК (Tel22C) и G-квадруплекс $\leftrightarrows$ развернутая одиночная нить в комплементарной ей d[5$^{\prime}$-A(GGGTTA)$_{3}$GGG-3$^{\prime}$] гуанин-богатой нити (Tel22G) при рН 5.5 и 400 млM Na$^{+}$. Обнаружено, что в этих условиях в Tel22C и Tel22G образуются устойчивые i-мотив и G-квадруплекс структуры. Показано, что мочевина (0–8 М) дестабилизирует i-мотив и G-квадруплекс структуры, но в отличие от термической денатурации не разрушает их полностью. Процессы плавления G-квадруплекса и i-мотива сильно разведены по температурной шкале (при любой концентрации мочевины плавление G-квадруплекса начинается при температурах, когда плавление i-мотива уже закончено).