Труды СПИИРАН
RUS  ENG    ЖУРНАЛЫ   ПЕРСОНАЛИИ   ОРГАНИЗАЦИИ   КОНФЕРЕНЦИИ   СЕМИНАРЫ   ВИДЕОТЕКА   ПАКЕТ AMSBIB  
Общая информация
Последний выпуск
Архив

Поиск публикаций
Поиск ссылок

RSS
Последний выпуск
Текущие выпуски
Архивные выпуски
Что такое RSS



Информатика и автоматизация:
Год:
Том:
Выпуск:
Страница:
Найти






Персональный вход:
Логин:
Пароль:
Запомнить пароль
Войти
Забыли пароль?
Регистрация


Труды СПИИРАН, 2016, выпуск 47, страницы 225–240
DOI: https://doi.org/10.15622/sp.47.12
(Mi trspy900)
 

Алгоритмы и программные средства

Полногеномный поиск ассоциаций с использованием матриц парных сравнений

Л. В. Уткинa, Ю. А. Жукb

a Санкт-Петербургский политехнический университет Петра Великого (СПбПУ)
b Санкт-Петербургский национальный исследовательский университет информационных технологий, механики и оптики (Университет ИТМО)
Аннотация: Предлагается простой метод определения значимости объектов популяции при установлении ассоциации между однонуклеотидными полиморфизмами и количественными признаками в полногеномном поиске ассоциаций. На первом этапе сравниваются пары объектов популяции с точки зрения расстояния между ними по фенотипу и генотипу. На втором этапе строятся матрицы парных сравнений объектов и вычисляются веса объектов в соответствии с аддитивной и мультипликативной шкалами. Показывается, как можно модифицировать метод Лассо с использованием весов. Числовые эксперименты с реальными данными иллюстрируют предлагаемый метод.
Ключевые слова: биоинформатика; регрессия; полногеномный поиск ассоциаций; парные сравнения; Лассо; аддитивные и мультипликативные шкалы.
Реферативные базы данных:
Тип публикации: Статья
УДК: 57.087
Образец цитирования: Л. В. Уткин, Ю. А. Жук, “Полногеномный поиск ассоциаций с использованием матриц парных сравнений”, Тр. СПИИРАН, 47 (2016), 225–240
Цитирование в формате AMSBIB
\RBibitem{UtkZhu16}
\by Л.~В.~Уткин, Ю.~А.~Жук
\paper Полногеномный поиск ассоциаций с использованием матриц парных сравнений
\jour Тр. СПИИРАН
\yr 2016
\vol 47
\pages 225--240
\mathnet{http://mi.mathnet.ru/trspy900}
\crossref{https://doi.org/10.15622/sp.47.12}
\elib{https://elibrary.ru/item.asp?id=26498873}
Образцы ссылок на эту страницу:
  • https://www.mathnet.ru/rus/trspy900
  • https://www.mathnet.ru/rus/trspy/v47/p225
  • Citing articles in Google Scholar: Russian citations, English citations
    Related articles in Google Scholar: Russian articles, English articles
    Информатика и автоматизация
    Статистика просмотров:
    Страница аннотации:199
    PDF полного текста:51
     
      Обратная связь:
     Пользовательское соглашение  Регистрация посетителей портала  Логотипы © Математический институт им. В. А. Стеклова РАН, 2024