|
Алгоритмы и программные средства
Полногеномный поиск ассоциаций с использованием матриц парных сравнений
Л. В. Уткинa, Ю. А. Жукb a Санкт-Петербургский политехнический университет Петра Великого (СПбПУ)
b Санкт-Петербургский национальный исследовательский университет информационных технологий, механики и оптики (Университет ИТМО)
Аннотация:
Предлагается простой метод определения значимости объектов популяции при установлении ассоциации между однонуклеотидными полиморфизмами и количественными признаками в полногеномном поиске ассоциаций. На первом этапе сравниваются пары объектов популяции с точки зрения расстояния между ними по фенотипу и генотипу. На втором этапе строятся матрицы парных сравнений объектов и вычисляются веса объектов в соответствии с аддитивной и мультипликативной шкалами. Показывается, как можно модифицировать метод Лассо с использованием весов. Числовые эксперименты с реальными данными иллюстрируют предлагаемый метод.
Ключевые слова:
биоинформатика; регрессия; полногеномный поиск ассоциаций; парные сравнения; Лассо; аддитивные и мультипликативные шкалы.
Образец цитирования:
Л. В. Уткин, Ю. А. Жук, “Полногеномный поиск ассоциаций с использованием матриц парных сравнений”, Тр. СПИИРАН, 47 (2016), 225–240
Образцы ссылок на эту страницу:
https://www.mathnet.ru/rus/trspy900 https://www.mathnet.ru/rus/trspy/v47/p225
|
Статистика просмотров: |
Страница аннотации: | 199 | PDF полного текста: | 51 |
|