|
Применимость приближения равновесности белкового окружения при описании сверхбыстрых биофизических процессов
В. В. Поддубный, И. О. Глебов, С. М. Сударькова Московский государственный университет им. М. В. Ломоносова, химический факультет, Москва, Россия
Аннотация:
Теоретическое описание сверхбыстрых процессов в биологических системах, в частности переноса электрона в фотосинтетических реакционных центрах, является важной задачей современной биологической физики. В силу того что эти процессы протекают в белковой среде, с которой возможен обмен энергией, для их описания необходимо применять методы квантовой теории открытых систем. Однако из-за высокой скорости и специфики белкового окружения основополагающие приближения теории могут не выполняться. Изучена применимость приближения неизменности состояния белкового окружения (термостата) для диссипативной динамики переноса заряда между молекулами-пигментами, входящими в состав реакционных центров. Для этого использованы модельные системы, параметры которых близки к реальным. Сделан вывод о том, что данное приближение справедливо для описания как монотонной, так и осциллирующей динамики реакционной подсистемы в крупных биологических молекулах. Рассмотрены различные механизмы термализации термостата
и показано, что термализация термостата происходит не за счет внутримолекулярного перераспределения колебательной энергии в нем, а только за счет его взаимодействия с реакционной подсистемой.
Ключевые слова:
квантовая теория открытых систем,
редуцированная матрица плотности, термостат, фотосинтетический реакционный центр, перенос электрона.
Поступило в редакцию: 12.12.2014
Образец цитирования:
В. В. Поддубный, И. О. Глебов, С. М. Сударькова, “Применимость приближения равновесности белкового окружения при описании сверхбыстрых биофизических процессов”, ТМФ, 183:3 (2015), 498–512; Theoret. and Math. Phys., 183:3 (2015), 878–889
Образцы ссылок на эту страницу:
https://www.mathnet.ru/rus/tmf8840https://doi.org/10.4213/tmf8840 https://www.mathnet.ru/rus/tmf/v183/i3/p498
|
Статистика просмотров: |
Страница аннотации: | 373 | PDF полного текста: | 149 | Список литературы: | 65 | Первая страница: | 40 |
|