Аннотация:
Представлен краткий обзор использования p-адического уравнения ультраметрического случайного блуждания для описания конформационной динамики белковых молекул. Рассмотрены два основных эксперимента, определяющих свойства флуктуационно-динамической подвижности белковых молекул от 300 до 4 K, – исследование кинетики связывания CO миоглобином и исследование спектральной диффузии в белках. Показано, что ультраметрическое описание позволяет сложить единую картину конформационной подвижности белковой молекулы во всей этой области температур и осознать тот факт, что она меняется самоподобным образом. Эта особенность белковых молекул, до сих пор остававшаяся скрытой, существенно расширяет представление об устройстве структур наноразмерного масштаба, относящихся к семейству молекулярных машин.
Образец цитирования:
В. А. Аветисов, А. Х. Бикулов, А. П. Зубарев, “Ультраметрическое случайное блуждание и динамика белковых молекул”, Избранные вопросы математической физики и анализа, Сборник статей. К 90-летию со дня рождения академика Василия Сергеевича Владимирова, Труды МИАН, 285, МАИК «Наука/Интерпериодика», М., 2014, 9–32; Proc. Steklov Inst. Math., 285 (2014), 3–25
\RBibitem{AveBikZub14}
\by В.~А.~Аветисов, А.~Х.~Бикулов, А.~П.~Зубарев
\paper Ультраметрическое случайное блуждание и динамика белковых молекул
\inbook Избранные вопросы математической физики и анализа
\bookinfo Сборник статей. К~90-летию со дня рождения академика Василия Сергеевича Владимирова
\serial Труды МИАН
\yr 2014
\vol 285
\pages 9--32
\publ МАИК «Наука/Интерпериодика»
\publaddr М.
\mathnet{http://mi.mathnet.ru/tm3553}
\crossref{https://doi.org/10.1134/S0371968514020022}
\elib{https://elibrary.ru/item.asp?id=21726838}
\transl
\jour Proc. Steklov Inst. Math.
\yr 2014
\vol 285
\pages 3--25
\crossref{https://doi.org/10.1134/S0081543814040026}
\isi{https://gateway.webofknowledge.com/gateway/Gateway.cgi?GWVersion=2&SrcApp=Publons&SrcAuth=Publons_CEL&DestLinkType=FullRecord&DestApp=WOS_CPL&KeyUT=000339949700002}
\elib{https://elibrary.ru/item.asp?id=24048332}
\scopus{https://www.scopus.com/record/display.url?origin=inward&eid=2-s2.0-84926283215}
Образцы ссылок на эту страницу:
https://www.mathnet.ru/rus/tm3553
https://doi.org/10.1134/S0371968514020022
https://www.mathnet.ru/rus/tm/v285/p9
Эта публикация цитируется в следующих 15 статьяx:
David Weisbart, “p-adic Brownian motion is a scaling limit”, J. Phys. A: Math. Theor., 57:20 (2024), 205203
A. Kh. Bikulov, A. P. Zubarev, “Power Laws and Logarithmic Oscillations in Diffusion Processes on Discrete Ultrametric Spaces”, P-Adic Num Ultrametr Anal Appl, 16:4 (2024), 327
W.A. Zúñiga-Galindo, “Ultrametric diffusion, rugged energy landscapes and transition networks”, Physica A: Statistical Mechanics and its Applications, 597 (2022), 127221
Bikulov A.Kh., Zubarev A.P., “Ultrametric Theory of Conformational Dynamics of Protein Molecules in a Functional State and the Description of Experiments on the Kinetics of Co Binding to Myoglobin”, Physica A, 583 (2021), 126280
Velasquez-Rodriguez J.P., “Hormander Classes of Pseudo-Differential Operators Over the Compact Group of P-Adic Integers”, P-Adic Numbers Ultrametric Anal. Appl., 12:2 (2020), 134–162
А. Х. Бикулов, А. П. Зубарев, “Новые базисы в пространстве квадратично интегрируемых функций на поле p-адических чисел и их приложения”, Математическая физика и приложения, Сборник статей. К 95-летию со дня рождения академика Василия Сергеевича Владимирова, Труды МИАН, 306, МИАН, М., 2019, 28–40; A. Kh. Bikulov, A. P. Zubarev, “New Bases in the Space of Square Integrable Functions on the Field of p-Adic Numbers and Their Applications”, Proc. Steklov Inst. Math., 306 (2019), 20–32
D. A. Dawson, L. G. Gorostiza, “Transience and recurrence of random walks on percolation clusters in an ultrametric space”, J. Theor. Probab., 31:1 (2018), 494–526
A. Kh. Bikulov, A. P. Zubarev, “Model of p -adic random walk in a potential”, P-Adic Numbers Ultrametric Anal. Appl., 10:2 (2018), 130–150
D. A. Dawson, L. G. Gorostiza, “Random systems in ultrametric spaces”, Adv. Appl. Probab., 50:A (2018), 83–97
B. Dragovich, A. Yu. Khrennikov, S. V. Kozyrev, I. V. Volovich, E. I. Zelenov, “p-Adic mathematical physics: the first 30 years”, P-Adic Numbers Ultrametric Anal. Appl., 9:2 (2017), 87–121
V. Avetisov, P. L. Krapivsky, S. Nechaev, “Native ultrametricity of sparse random ensembles”, J. Phys. A-Math. Theor., 49:3 (2016), 035101
А. Х. Бикулов, А. П. Зубарев, “Полные системы собственных функций оператора Владимирова в L2(Br) и L2(Qp)”, Фундамент. и прикл. матем., 21:3 (2016), 39–56; A. Kh. Bikulov, A. P. Zubarev, “Complete systems of eigenfunctions of the Vladimirov operator in L2(Br) and L2(Qp)”, J. Math. Sci., 237:3 (2019), 362–374
О. М. Сизова, “Ультраметрическая диффузия в сильном центрально-симметричном поле”, Вестн. Сам. гос. техн. ун-та. Сер. Физ.-мат. науки, 19:1 (2015), 87–104
С. В. Козырев, “Ультраметрика в теории сложных систем”, ТМФ, 185:2 (2015), 346–360; S. V. Kozyrev, “Ultrametricity in the theory of complex systems”, Theoret. and Math. Phys., 185:2 (2015), 1665–1677