Аннотация:
В настоящем обзоре описаны основные базы данных, содержащие информацию о метаболизме ксенобиотиков, включая данные о метаболизируемых лекарственных средствах, метаболических ферментах, схемах реакций биотрансформации, структуры некоторых субстратов и метаболитов. Рассмотрены компьютерные подходы, применяемые для предсказания взаимодействия ксенобиотиков с ферментами метаболизма, прогноза сайтов метаболизма в молекуле, генерации структур потенциальных метаболитов с целью последующей оценки их свойств. Указаны преимущества и ограничения различных расчетных методов прогноза метаболизма и проанализированы перспективы их применения для повышения безопасности и эффективности новых лекарственных средств.
Библиография — 165 ссылок.
Образец цитирования:
В. М. Беженцев, О. А. Тарасова, А. В. Дмитриев, А. В. Рудик, А. А. Лагунин, Д. А. Филимонов, В. В. Поройков, “Компьютерный прогноз путей метаболизма ксенобиотиков в организме человека”, Усп. хим., 85:8 (2016), 854–879; Russian Chem. Reviews, 85:8 (2016), 854–879
Dmitry Filimonov, Alexander Dmitriev, Anastassia Rudik, Vladimir Poroikov, Computational Methods in Engineering & the Sciences, Machine Learning and Deep Learning in Computational Toxicology, 2023, 21
L. A. Vaimugin, K. S. Nikonov, L. V. Moiseeva, M. N. Brekhovskikh, Inorg Mater, 59:9 (2023), 1002
Л. А. Ваймугин, К. С. Никонов, Л. В. Моисеева, М. Н. Бреховских, Неорганические материалы, 59:9 (2023), 1043
Usman Ali Ashfaq, Farah Shahid, Samman Munir, Biochemistry of Drug Metabolizing Enzymes, 2022, 29
Jonathan D Tyzack, Comprehensive Pharmacology, 2022, 769
V. V. Poroikov, Biochem. Mosc.-Suppl. Ser. B-Biomed. Chem., 14:3 (2020), 216–227
D. A. Filimonov, A. V. Rudik, A. V. Dmitriev, V. V. Poroikov, Int. J. Mol. Sci., 21:20 (2020), 7492
J. Fine, J. Konc, R. Samudrala, G. Chopra, J. Chem Inf. Model., 60:3 (2020), 1509–1527
V.V. Poroikov, BIOMED KHIM, 66:1 (2020), 30
D. A. Filimonov, A. V. Rudik, A. V. Dmitriev, A. A. Lagunin, V. V. Poroikov, BIOPHYSICS, 65:6 (2020), 1023
V. V. Shumyantseva, A. A. Makhova, E. V. Shikh, T. V. Bulko, A. V. Kuzikov, R. A. Masamrekh, T. Shkel, S. Usanov, A. Gilep, A. I. Archakov, BioNanoScience, 9:1 (2019), 79–86
J. D. Tyzack, J. Kirchmair, Chem. Biol. Drug Des., 93:4 (2019), 377–386
A. Rudik, V. Bezhentsev, A. Dmitriev, A. Lagunin, D. Filimonov, V. Poroikov, J. Bioinform. Comput. Biol., 17:1, SI (2019), 1940001
A. V. Dmitriev, A. A. Lagunin, D. A. Karasev, A. V. Rudik, P. V. Pogodin, D. A. Filimonov, V. V. Poroikov, Curr. Top. Med. Chem., 19:5 (2019), 319–336
A. V. Rudik, A. V. Dmitriev, A. A. Lagunin, S. M. Ivanov, D. A. Filimonov, V. V. Poroikov, Biochem. Mosc.-Suppl. Ser. B-Biomed. Chem., 13:3 (2019), 228–236
J. Mitkov, M. Kondeva-Burdina, A. Zlatkov, Pharmacia, 66:3 (2019), 99–106