Программные системы: теория и приложения
RUS  ENG    ЖУРНАЛЫ   ПЕРСОНАЛИИ   ОРГАНИЗАЦИИ   КОНФЕРЕНЦИИ   СЕМИНАРЫ   ВИДЕОТЕКА   ПАКЕТ AMSBIB  
Общая информация
Последний выпуск
Архив
Правила для авторов
Загрузить рукопись

Поиск публикаций
Поиск ссылок

RSS
Последний выпуск
Текущие выпуски
Архивные выпуски
Что такое RSS


Программные системы: теория и приложения:
Год:
Том:
Выпуск:
Страница:
Найти




Персональный вход:
Логин:
Пароль:
Запомнить пароль
Войти
Забыли пароль?
Регистрация

Программные системы: теория и приложения, 2017, том 8, выпуск 2, страницы 45–68
DOI: https://doi.org/10.25209/2079-3316-2017-8-2-45-68 (Mi ps262) 		 
Эта публикация цитируется в 1 научной статье (всего в 1 статье)

Программное и аппаратное обеспечение распределенных и суперкомпьютерных систем

Компьютерные средства анализа транскриптомных данных: программный комплекc ExpGene

А. М. Спицинаa, А. О. Брагинb, А. И. Дергилевa, И. В. Чадаеваb, Н. Н. Твердохлебb, Э. Р. Галиеваb, Л. Э. Табихановаb, Ю. Л. Орловb

a Новосибирский государственный университет
b Институт цитологии и генетики СО РАН
PDF полного текста (1646 kB) Список цитирования (1)
Список литературы:
PDF
HTML
DOI: https://doi.org/10.25209/2079-3316-2017-8-2-45-68
Аннотация: Технологии высокопроизводительного секвенирования ДНК позволяют получать данные экспрессии генов в масштабе генома, как на микрочипах, так и на основе транскриптомного профилирования. Необходимо развитие новых компьютерных методов анализа таких данных, опирающихся на суперкомпьютерные технологии. Рассмотрены задачи анализа транскриптом в контексте вычислительной сложности. Представлены примеры применения программного комплекса ExpGene для статистической обработки и визуализации транскриптомных и микрочиповых данных. Показаны приложения для анализа транскриптом отделов мозга лабораторных животных.
Ключевые слова и фразы: биоинформатика, программный комплекс, секвенирование ДНК, транскриптом, экспрессия генов, микрочипы, базы данных.
Финансовая поддержка Номер гранта
Российская академия наук - Федеральное агентство научных организаций 0324-2016-0008
Исследование поддержано бюджетным проектом ИЦиГ СО РАН 0324-2016-0008.
Поступила в редакцию: 17.04.2017
Подписана в печать : 15.05.2017
Тип публикации: Статья
УДК: 57.05; 004.031.2
Образец цитирования: А. М. Спицина, А. О. Брагин, А. И. Дергилев, И. В. Чадаева, Н. Н. Твердохлеб, Э. Р. Галиева, Л. Э. Табиханова, Ю. Л. Орлов, “Компьютерные средства анализа транскриптомных данных: программный комплекc ExpGene”, Программные системы: теория и приложения, 8:2 (2017), 45–68
Цитирование в формате AMSBIB
\RBibitem{SpiBraDer17}
\by А.~М.~Спицина, А.~О.~Брагин, А.~И.~Дергилев, И.~В.~Чадаева, Н.~Н.~Твердохлеб, Э.~Р.~Галиева, Л.~Э.~Табиханова, Ю.~Л.~Орлов
\paper Компьютерные средства анализа транскриптомных данных: программный комплекc ExpGene
\jour Программные системы: теория и приложения
\yr 2017
\vol 8
\issue 2
\pages 45--68
\mathnet{http://mi.mathnet.ru/ps262}
\crossref{https://doi.org/10.25209/2079-3316-2017-8-2-45-68}
Образцы ссылок на эту страницу:
  • https://www.mathnet.ru/rus/ps262
  • https://www.mathnet.ru/rus/ps/v8/i2/p45
    • Эта публикация цитируется в следующих 1 статьяx:
    Citing articles in Google Scholar: Russian citations, English citations
    Related articles in Google Scholar: Russian articles, English articles
    		Программные системы: теория и приложения
    Статистика просмотров:
    Страница аннотации:234
    PDF полного текста:198
    Список литературы:38
     
      Обратная связь:
    		  Пользовательское соглашение  Регистрация посетителей портала  Логотипы © Математический институт им. В. А. Стеклова РАН, 2024