|
Программные системы: теория и приложения, 2015, том 6, выпуск 1, страницы 157–174
(Mi ps162)
|
|
|
|
Эта публикация цитируется в 3 научных статьях (всего в 3 статьях)
Программное и аппаратное обеспечение распределенных и суперкомпьютерных систем
Суперкомпьютерный анализ геномных и транскриптомных данных, полученных с помощью технологий высокопроизводительного секвенирования ДНК
А. М. Спицинаa, Ю. Л. Орловa, Н. Н. Подколоднаяa, А. В. Свичкаревb, А. И. Дергилевb, М. Ченc, Н. В. Кучинd, И. Г. Черныхd, Б. М. Глинскийd a Институт цитологии и генетики СО РАН
b Новосибирский государственный университет
c Университет Чжецзянь, г. Ханчжоу, Китай
d Институт вычислительной математики и математической геофизики СО РАН
Аннотация:
Развитие технологий высокопроизводительного секвенирования ДНК привело к появлению нового класса объемных геномных данных и алгоритмов их обработки и анализа. Суперкомпьютерные вычисления являются необходимым инструментом работы с генетическими данными. Представлены задачи геномики и транскриптомики, анализа экспрессии генов в контексте вычислительной сложности. Дан обзор компьютерных подходов и разработанных авторами программ для решения задач, возникающих при аннотации геномных данных и анализе экспрессии генов.
Ключевые слова и фразы:
биоинформатика, секвенирование ДНК, микрочипы, регуляция экспрессии генов, транскрипция, базы данных.
Поступила в редакцию: 26.12.2014 Подписана в печать : 24.02.2015
Образец цитирования:
А. М. Спицина, Ю. Л. Орлов, Н. Н. Подколодная, А. В. Свичкарев, А. И. Дергилев, М. Чен, Н. В. Кучин, И. Г. Черных, Б. М. Глинский, “Суперкомпьютерный анализ геномных и транскриптомных данных, полученных с помощью технологий высокопроизводительного секвенирования ДНК”, Программные системы: теория и приложения, 6:1 (2015), 157–174
Образцы ссылок на эту страницу:
https://www.mathnet.ru/rus/ps162 https://www.mathnet.ru/rus/ps/v6/i1/p157
|
|