Биоинформатика и поиск сдвигов рамки считывания в генах

Кратко рассматриваются основные задачи, стоящие перед биоинформатикой, в частности:
– анализ нуклеотидных и аминокислотных последовательностей,
– предсказание белковых структур на основе знания аминокислотных последовательностей,
– изучение данных, полученных при помощи биочипов,
– создание динамических моделей генетических сетей.
В качестве примера решаемой задачи рассматривается поиск мутаций в генах посредством сдвига рамки считывания и разработка математических методов для их идентификации. Для поиска сдвигов рамки считывания введено понятие сдвига фазы триплетной периодичности нуклеотидной последовательности и предложен математический алгоритм для его выявления. При изучении последовательностей генов из банка данных Kegg-46 было выявлено 27417 тысяч генов (0,7% от общего их числа в базе данных Kegg), имеющих сдвиг фазы триплетной периодичности.