|
Проблемы передачи информации, 2014, том 50, выпуск 3, страницы 51–75
(Mi ppi2144)
|
|
|
|
Эта публикация цитируется в 2 научных статьях (всего в 2 статьях)
Теория кодирования
ДНК-коды для неаддитивного стебельного сходства
А. Г. Дьячковa, А. Н. Кузинаa, Н. А. Полянскийa, А. Макулаb, В. В. Рыковc a Московский государственный университет им. М. В. Ломоносова, механико-математический факультет, кафедра теории вероятностей
b Университет штата Нью-Йорк в Дженезео, математическое
отделение
c Небрасский университет в Омахе
Аннотация:
ДНК-последовательностями называются последовательности с элементами из четверичного ДНК-алфавита $\{A,C,G,T\}$, существенной особенностью которых является их направленность и способность образовывать дуплексы в результате процесса гибридизации – сращивания двух противоположно направленных последовательностей. В биологических экспериментах, использующих это свойство, необходимым является создание ансамблей таких последовательностей (ДНК-кодов), которые состоят из пар ДНК-последовательностей, называемых дуплексами Ватсона–Крика. Кроме того, энергия гибридизации – мера устойчивости потенциального ДНК-дуплекса – для любых двух слов ДНК-кода, не образующих дуплекс Ватсона–Крика, ограничена сверху некоторым числом, определяемым условиями эксперимента. Такая задача может быть естественным образом интерпретирована в терминах теории кодирования. В продолжение предыдущих работ рассматривается неаддитивная функция сходства двух ДНК-последовательностей, позволяющая наиболее адекватно моделировать энергию их гибридизации. Для максимального объема ДНК-кодов, основанных на таком сходстве, устанавливается верхняя граница Синглтона и приводится пример оптимальной конструкции. С помощью ансамблей ДНК-кодов со специальными ограничениями на кодовые слова (ансамблей Фибоначчи) получена нижняя граница случайного кодирования на максимальный объем ДНК-кодов при указанном сходстве.
Поступила в редакцию: 24.06.2013 После переработки: 16.12.2013
Образец цитирования:
А. Г. Дьячков, А. Н. Кузина, Н. А. Полянский, А. Макула, В. В. Рыков, “ДНК-коды для неаддитивного стебельного сходства”, Пробл. передачи информ., 50:3 (2014), 51–75; Problems Inform. Transmission, 50:3 (2014), 247–269
Образцы ссылок на эту страницу:
https://www.mathnet.ru/rus/ppi2144 https://www.mathnet.ru/rus/ppi/v50/i3/p51
|
Статистика просмотров: |
Страница аннотации: | 345 | PDF полного текста: | 68 | Список литературы: | 52 | Первая страница: | 25 |
|