КГУ является обладателем сертификата системы менеджмента качества по международным стандартам ИСО 9001:2000. В декабре 2005 года КГУ прошел государственную аттестацию, подтвердив лицензию на образовательную деятельность.

В состав университета входят семь институтов: гуманитарно-социальный, математики и компьютерных технологий, инженерно-физический, аграрно-биологический, ветеринарной медицины и зоотехнии, права, экономики и финансов.