Организован в 1950 как Институт высшей нервной деятельности (современное название с 1960). Основные работы по изучению нейрофизиологических механизмов обучения и нейробиологических основ сознания.
Исследовательская программа Института концентрируется вокруг двух основных тем: "Обучающийся мозг" и "Нейробиологические основы сознания". Эти темы сотрудники Института разрабатывают в тесном контакте с Московским государственным университетом им. М. В. Ломоносова, психоневрологической и нейрохирургической клиниками, с учреждениями, ведущими прикладные исследования в области психофизиологии труда.