|
Математическое моделирование, 2016, том 28, номер 5, страницы 95–108
(Mi mm3732)
|
|
|
|
Эта публикация цитируется в 14 научных статьях (всего в 14 статьях)
Эффективность алгоритмов классической молекулярной динамики на суперкомпьютерном аппаратном обеспечении
Г. С. Смирновab, В. В. Стегайловab a Московский физико-технический институт (Государственный университет)
b Объединенный институт высоких температур РАН
Аннотация:
Развитие аппаратного обеспечения для высокопроизводительных расчетов опережает адаптацию алгоритмов для таких фундаментальных математических алгоритмов, как классическая молекулярная динамика. Большое разнообразие выбора обуславливает необходимость ясных критериев, основанных на вычислительной эффективности определенного алгоритма на определенном аппаратном обеспечении. Тест LINPACK не может более служить этой цели. В этой работе мы рассматриваем основанную на практических соображениях метрику «время решения–пиковая производительность». В этой метрике мы сравниваем различное аппаратное обеспечение (как современное, так и вышедшее из употребления) на примере тестов программного обеспечения LAMMPS, широко используемого для атомистического моделирования. Показано, что рассмотренная метрика может служить для однозначного сравнения различных комбинаций центральных процессоров, ускорителей и интерконнекта.
Ключевые слова:
атомистическое моделирование, архитектура процессоров, ускорители, пиковая производительность.
Поступила в редакцию: 21.04.2015
Образец цитирования:
Г. С. Смирнов, В. В. Стегайлов, “Эффективность алгоритмов классической молекулярной динамики на суперкомпьютерном аппаратном обеспечении”, Матем. моделирование, 28:5 (2016), 95–108; Math. Models Comput. Simul., 8:6 (2016), 734–743
Образцы ссылок на эту страницу:
https://www.mathnet.ru/rus/mm3732 https://www.mathnet.ru/rus/mm/v28/i5/p95
|
Статистика просмотров: |
Страница аннотации: | 450 | PDF полного текста: | 183 | Список литературы: | 53 | Первая страница: | 18 |
|