|
Математическое моделирование, 2010, том 22, номер 11, страницы 18–28
(Mi mm3037)
|
|
|
|
Эта публикация цитируется в 1 научной статье (всего в 1 статье)
Моделирование из первых принципов молекулярного переключателя на основе реакции изомеризации
Г. Н. Шумкинa, А. М. Поповa, А. Куриониb, Т. Лайноb a Московский государственный университет им. М. В. Ломоносова, факультет вычислительной математики и кибернетики
b Исследовательский отдел ИБМ, Исследовательская лаборатория в Цюрихе, Рушликон, Швейцария
Аннотация:
В работе представлено математическое моделирование “из первых принципов” молекулярного переключения на основе реакции изомеризации в молекуле нафталоцианина, индуцированной током сканирующего туннельного микроскопа. Поверхность свободной энергии Гиббса и путь реакции анализируется методом “метадинамики” в рамках численного квантовомеханического кода молекулярной динамики Кар-Парринелло “CPMD”. Расчеты проведены на супер-ЭВМ IBM Blue Gene/P, установленной на факультете ВМК МГУ. Вдоль введенной координационной переменной найдена высота энергетического барьера, который следует преодолеть для прохождения реакции водородной изомеризации. Проведен анализ эволюции электронной плотности в процессе переключения.
Ключевые слова:
моделирование “из первых принципов”, квантовая молекулярная динамика, молекулярные переключатели.
Поступила в редакцию: 08.02.2010
Образец цитирования:
Г. Н. Шумкин, А. М. Попов, А. Куриони, Т. Лайно, “Моделирование из первых принципов молекулярного переключателя на основе реакции изомеризации”, Матем. моделирование, 22:11 (2010), 18–28; Math. Models Comput. Simul., 3:3 (2011), 375–381
Образцы ссылок на эту страницу:
https://www.mathnet.ru/rus/mm3037 https://www.mathnet.ru/rus/mm/v22/i11/p18
|
|