|
Математическое моделирование, 2009, том 21, номер 3, страницы 31–40
(Mi mm2745)
|
|
|
|
Эта публикация цитируется в 1 научной статье (всего в 1 статье)
GPAMM – программный пакет для расчетов молекулярной динамики на графических процессорах
Д. С. Тарасовa, Е. Д. Изотоваb, Д. А. Алишеваb, Н. И. Акбероваb a Суперкомпьютерный центр коллективного пользования КНЦ РАН
b Казанский государственный университет
Аннотация:
Представлен программный пакет и рассмотрены соответствующие алгоритмы для расчетов молекулярной динамики на графических процессорах (GPU) NVIDIA G80, G84, G92 с использованием технологии NVIDIA CUDA. Реализованы потенциалы MM2 и AMBER с возможностью комбинации функций для создания других потенциалов. Поддерживается расчет молекулярной динамики в условиях NVT (канонический ансамбль) и NVE (микроканонический ансамбль). Сравнивается производительность кода для различных графических процессоров с производительностью МД-алгоритмов для процессоров Intel Celeron, Intel Pentium 4 и Intel Core2 Duo. Показано, что прирост производительности составляет до 30 раз. Программный пакет доступен по адресу www.gpamm.mntech.ru
Поступила в редакцию: 16.04.2008
Образец цитирования:
Д. С. Тарасов, Е. Д. Изотова, Д. А. Алишева, Н. И. Акберова, “GPAMM – программный пакет для расчетов молекулярной динамики на графических процессорах”, Матем. моделирование, 21:3 (2009), 31–40; Math. Models Comput. Simul., 2:1 (2010), 46–54
Образцы ссылок на эту страницу:
https://www.mathnet.ru/rus/mm2745 https://www.mathnet.ru/rus/mm/v21/i3/p31
|
Статистика просмотров: |
Страница аннотации: | 913 | PDF полного текста: | 203 | Список литературы: | 57 | Первая страница: | 53 |
|