|
Математическая биология и биоинформатика, 2010, том 5, выпуск 2, страницы 138–149
(Mi mbb57)
|
|
|
|
Материалы Международной конференции «Математическая биология и биоинформатика»
Новые поляризуемые атомные силовые поля для расчета невалентных взаимодействий в явно и неявно заданном водном окружении
А. В. Финкельштейн, Л. Б. Переяславец Институт белка Российской Академии Наук, г Пущино, Московская обл.
Аннотация:
Разработана новая функциональная форма для силового поля невалентных взаимодействий, учитывающая, наряду с традиционными членами, наведенную молекулярными парциальными зарядами поляризацию и всех атомов взаимодействующих молекул, и окружающего их растворителя. В рамках этой единой функциональной формы силового поля оптимизированы параметры всех невалентных взаимодействий атомов и при явном (в силовом поле PFFsubl), и при неявном (в силовом поле PFFsol) учете водного окружения. С оптимизированными параметрами обоих разработанных полей, коэффициент корреляции между рассчитанной и экспериментально определенной силы когезии молекул в кристаллах составил 93 – 95% и в вакуумном, и в неявно заданном водном окружении.
Ключевые слова:
невалентные атом-атомные взаимодействия, поляризация, парциальные заряды, неявный учет водного окружения, молекулярные кристаллы, сублимация, растворимость.
Материал поступил в редакцию 29.11.2010, опубликован 08.12.2010
Образец цитирования:
А. В. Финкельштейн, Л. Б. Переяславец, “Новые поляризуемые атомные силовые поля для расчета невалентных взаимодействий в явно и неявно заданном водном окружении”, Матем. биология и биоинформ., 5:2 (2010), 138–149
Образцы ссылок на эту страницу:
https://www.mathnet.ru/rus/mbb57 https://www.mathnet.ru/rus/mbb/v5/i2/p138
|
Статистика просмотров: |
Страница аннотации: | 340 | PDF полного текста: | 103 | Список литературы: | 54 | Первая страница: | 1 |
|