Аннотация:
Исследована предложенная ранее Скуртисом и Нитцаном и обобщенная в данной работе квантово-статистическая модель переноса заряда по фрагменту искусственного ДНК. В рамках предлагаемой модели проведено численное моделирование транспорта заряженного носителя с учетом двух различных диссипативных процессов, включая захват носителя окружающей средой и декогеренцию его квантово-волнового движения за счет воздействия со стороны стохастических полей окружения. Взаимодействие носителя с окружением регулируется небольшим набором феноменологических параметров численные значения которых варьируются в процессе моделирования. Наблюдаемые характеристики движения заряда по молекуле ДНК сравниваются с решением квантового основного уравнения Коссаковского–Линдблада–Глаубера–Сударшана (далее уравнение Линдблада) для матрицы плотности носителя с использованием программы Lindblad MPO Solver. Полученные в этом подходе результаты численного анализа модели согласуются с экспериментальными наблюдениями и демонстрируют два режима движения заряженного носителя, предположительно – туннельный и прыжковый, в коротких и длинных фрагментах ДНК, соответственно. В заключении кратко обсуждаются основные концепции теории непрерывного измерения, декогеренции и суперотбора для открытых квантовых систем и перспективы их применения для дальнейшего изучения переноса заряда в молекуле ДНК.
Ключевые слова:
электронная структура ДНК, моделирование процесса переноса заряда в ДНК, открытая квантовая система, уравнение Линдблада.
Материал поступил в редакцию 17.04.2024, 24.05.2024, опубликован 26.06.2024
Реферативные базы данных:
Тип публикации:
Статья
Образец цитирования:
А. В. Сюракшин, В. Д. Лахно, В. Ю. Юшанхай, “Компьютерное моделирование переноса заряда в молекуле ДНК в рамках простой модели открытой квантовой системы”, Матем. биология и биоинформ., 19:1 (2024), 212–231
\RBibitem{SyuLakYus24}
\by А.~В.~Сюракшин, В.~Д.~Лахно, В.~Ю.~Юшанхай
\paper Компьютерное моделирование переноса заряда в молекуле ДНК в рамках простой модели открытой квантовой системы
\jour Матем. биология и биоинформ.
\yr 2024
\vol 19
\issue 1
\pages 212--231
\mathnet{http://mi.mathnet.ru/mbb555}
\crossref{https://doi.org/10.17537/2024.19.212}
\elib{https://elibrary.ru/item.asp?id=68485694}
Образцы ссылок на эту страницу:
https://www.mathnet.ru/rus/mbb555
https://www.mathnet.ru/rus/mbb/v19/i1/p212
Эта публикация цитируется в следующих 1 статьяx:
A.N. Korshunova, V.D. Lakhno, “Bloch internal dynamics of a polaron uniformly moving in a constant electric field along molecular chains of various lengths”, Chaos, Solitons & Fractals, 191 (2025), 115930