Loading [MathJax]/jax/output/SVG/config.js
Математическая биология и биоинформатика
RUS  ENG    ЖУРНАЛЫ   ПЕРСОНАЛИИ   ОРГАНИЗАЦИИ   КОНФЕРЕНЦИИ   СЕМИНАРЫ   ВИДЕОТЕКА   ПАКЕТ AMSBIB  
Общая информация
Последний выпуск
Архив
Импакт-фактор

Поиск публикаций
Поиск ссылок

RSS
Последний выпуск
Текущие выпуски
Архивные выпуски
Что такое RSS



Матем. биология и биоинформ.:
Год:
Том:
Выпуск:
Страница:
Найти






Персональный вход:
Логин:
Пароль:
Запомнить пароль
Войти
Забыли пароль?
Регистрация


Математическая биология и биоинформатика, 2024, том 19, выпуск 1, страницы 212–231
DOI: https://doi.org/10.17537/2024.19.212
(Mi mbb555)
 

Эта публикация цитируется в 1 научной статье (всего в 1 статье)

Математическое моделирование

Компьютерное моделирование переноса заряда в молекуле ДНК в рамках простой модели открытой квантовой системы

А. В. Сюракшинa, В. Д. Лахноb, В. Ю. Юшанхайcd

a Естественнонаучный институт, Самарский национальный исследовательский университет им. С.П. Королева, Самара, Россия
b Институт математических проблем биологии РАН— филиал ИПМ им. М.В. Келдыша РАН, Пущино, Россия
c Лаборатория теоретической физики им. Н.Н. Боголюбова, ОИЯИ, Дубна, Россия
d Государственный университет "Дубна", Дубна, Россия
Список литературы:
Аннотация: Исследована предложенная ранее Скуртисом и Нитцаном и обобщенная в данной работе квантово-статистическая модель переноса заряда по фрагменту искусственного ДНК. В рамках предлагаемой модели проведено численное моделирование транспорта заряженного носителя с учетом двух различных диссипативных процессов, включая захват носителя окружающей средой и декогеренцию его квантово-волнового движения за счет воздействия со стороны стохастических полей окружения. Взаимодействие носителя с окружением регулируется небольшим набором феноменологических параметров численные значения которых варьируются в процессе моделирования. Наблюдаемые характеристики движения заряда по молекуле ДНК сравниваются с решением квантового основного уравнения Коссаковского–Линдблада–Глаубера–Сударшана (далее уравнение Линдблада) для матрицы плотности носителя с использованием программы Lindblad MPO Solver. Полученные в этом подходе результаты численного анализа модели согласуются с экспериментальными наблюдениями и демонстрируют два режима движения заряженного носителя, предположительно – туннельный и прыжковый, в коротких и длинных фрагментах ДНК, соответственно. В заключении кратко обсуждаются основные концепции теории непрерывного измерения, декогеренции и суперотбора для открытых квантовых систем и перспективы их применения для дальнейшего изучения переноса заряда в молекуле ДНК.
Ключевые слова: электронная структура ДНК, моделирование процесса переноса заряда в ДНК, открытая квантовая система, уравнение Линдблада.
Материал поступил в редакцию 17.04.2024, 24.05.2024, опубликован 26.06.2024
Реферативные базы данных:
Тип публикации: Статья
Образец цитирования: А. В. Сюракшин, В. Д. Лахно, В. Ю. Юшанхай, “Компьютерное моделирование переноса заряда в молекуле ДНК в рамках простой модели открытой квантовой системы”, Матем. биология и биоинформ., 19:1 (2024), 212–231
Цитирование в формате AMSBIB
\RBibitem{SyuLakYus24}
\by А.~В.~Сюракшин, В.~Д.~Лахно, В.~Ю.~Юшанхай
\paper Компьютерное моделирование переноса заряда в молекуле ДНК в рамках простой модели открытой квантовой системы
\jour Матем. биология и биоинформ.
\yr 2024
\vol 19
\issue 1
\pages 212--231
\mathnet{http://mi.mathnet.ru/mbb555}
\crossref{https://doi.org/10.17537/2024.19.212}
\elib{https://elibrary.ru/item.asp?id=68485694}
Образцы ссылок на эту страницу:
  • https://www.mathnet.ru/rus/mbb555
  • https://www.mathnet.ru/rus/mbb/v19/i1/p212
  • Эта публикация цитируется в следующих 1 статьяx:
    1. A.N. Korshunova, V.D. Lakhno, “Bloch internal dynamics of a polaron uniformly moving in a constant electric field along molecular chains of various lengths”, Chaos, Solitons & Fractals, 191 (2025), 115930  crossref
    Citing articles in Google Scholar: Russian citations, English citations
    Related articles in Google Scholar: Russian articles, English articles
    Статистика просмотров:
    Страница аннотации:61
    PDF полного текста:28
    Список литературы:2
     
      Обратная связь:
     Пользовательское соглашение  Регистрация посетителей портала  Логотипы © Математический институт им. В. А. Стеклова РАН, 2025