|
Эта публикация цитируется в 1 научной статье (всего в 1 статье)
Биоинформатика
Применение технологий виртуального скрининга и молекулярного моделирования для идентификации потенциальных ингибиторов основной протеазы коронавируса SARS-CoV-2
А. М. Андриановa, К. В. Фурсb, А. В. Гончарb, Л. А. Асланянc, А. В. Тузиковb a Институт биоорганической химии, Национальная академия наук Беларуси, Минск, Республика Беларусь
b Объединенный институт проблем информатики, Национальная академия наук Беларуси, Минск, Республика Беларусь
c Институт проблем информатики и автоматизации Национальной академии наук Республики Армения, Ереван, Армения
Аннотация:
Проведен виртуальный скрининг молекулярной библиотеки биологически активных соединений, направленный на идентификацию потенциальных ингибиторов основной протеазы (Mpro) SARS-CoV-2, играющей важную роль в процессе репликации вируса. Методами молекулярного докинга и молекулярной динамики выполнена оценка энергии связывания этих соединений с каталитическим сайтом фермента, в результате которой идентифицированы шесть молекул, проявляющих высокое химическое сродство к Mpro SARS-CoV-2. Об этом свидетельствуют низкие значения свободной энергии образования комплексов лиганд/Mpro, сопоставимые с величинами, предсказанными для мощного нековалентного ингибитора Mpro SARS-CoV-2 с использованием идентичного вычислительного протокола. На основе полученных данных сделан вывод о том, что найденные соединения обладают хорошим терапевтическим потенциалом для ингибирования каталитической активности фермента и формируют перспективные базовые структуры для разработки новых эффективных препаратов против COVID-19.
Ключевые слова:
SARS-CoV-2, основная протеаза, виртуальный скрининг, молекулярный докинг, молекулярная динамика, противовирусные препараты.
Материал поступил в редакцию 27.01.2023, 12.02.2023, опубликован 22.02.2023
Образец цитирования:
А. М. Андрианов, К. В. Фурс, А. В. Гончар, Л. А. Асланян, А. В. Тузиков, “Применение технологий виртуального скрининга и молекулярного моделирования для идентификации потенциальных ингибиторов основной протеазы коронавируса SARS-CoV-2”, Матем. биология и биоинформ., 18:1 (2023), 15–32
Образцы ссылок на эту страницу:
https://www.mathnet.ru/rus/mbb506 https://www.mathnet.ru/rus/mbb/v18/i1/p15
|
Статистика просмотров: |
Страница аннотации: | 38 | PDF полного текста: | 9 | Список литературы: | 7 |
|