|
Обзоры
Проблемы квантово-классического моделирования первичной фотореакции в родопсине
А. С. Шигаев, И. В. Лихачев, В. Д. Лахно Институт математических проблем биологии РАН – филиал ИПМ им. М.В. Келдыша РАН, Пущино, Россия
Аннотация:
Исследована модицифированная модель первичной фотореакции в родопсине – цис-транс фотоизомеризации хромофора (ретиналя). Квантовая подсистема модели включает три вибронных состояния: основное состояние, возбуждённое состояние и основное состояние первичного фотопродукта. Данным состояниям соответствуют три точечные массы в классической подсистеме. Модификация заключается в экспоненциальной зависимости электронно-колебательной константы связи от смещения точечных масс. Исследованы свойства оптимальных локусов многопараметрического пространства, для которых характерно наилучшее согласие с экспериментальными данными. Показан достаточно малый “многомерный объём” данных локусов во всех диапазонах используемых значений параметров модели. Предложен ряд путей оптимизации квантово-классической модели фотоизомеризации родопсина.
Ключевые слова:
родопсин, хромофор, ретиналь, хромофор, цис-транс фотоизомеризация, поверхность потенциальной энергии, квантово-классическая модель.
Материал поступил в редакцию 27.10.2022, 19.11.2022, опубликован 30.11.2022
Образец цитирования:
А. С. Шигаев, И. В. Лихачев, В. Д. Лахно, “Проблемы квантово-классического моделирования первичной фотореакции в родопсине”, Матем. биология и биоинформ., 17:2 (2022), 360–385
Образцы ссылок на эту страницу:
https://www.mathnet.ru/rus/mbb494 https://www.mathnet.ru/rus/mbb/v17/i2/p360
|
Статистика просмотров: |
Страница аннотации: | 68 | PDF полного текста: | 23 | Список литературы: | 10 |
|