|
Биоинформатика
Additional pathogenic pathways in RBCK1 deficiency
[Дополнительные пути патогенеза RBCK1 дефицита]
E. I. Demichevaab, Kh. Shinwarib, K. S. Usheninab, M. A. Bolkovab a Institute of Immunology and Physiology, Ekaterinburg, Russia
b Ural Federal University, Ekaterinburg, Russia
Аннотация:
RBCK1 дефицит – редкое врожденное наследственное заболевание аутовоспалительной природы, которое вызывает нарушение воспалительных процессов на молекулярном уровне. Данное заболевание имеет три основных клинических проявления: повышенную чувствительность к бактериальным инфекциям, синдром аутовоспаления и накопление амилопектина в скелетных мышцах. Амилопектиноз вызывает миопатию и кардиомиопатию. Патогенез заболевания мало изучен и может включать незамеченные взаимосвязи. В данной работе был проведен анализ дифференциальной экспрессии генов у пациентов с RBCK1 дефицитом и тремя другими аутовоспалительными заболеваниями. Идентификация дифференциально экспрессированных генов выявила большое число генов с пониженной экспрессией, которые вовлечены в активацию ключевых метаболических и имунных путей, включающих Nf-kb и Pi3k-Akt-mTOR. Сигнальные пути были проанализированы с использованием KEGG (Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes) и ресурса Gene Ontology. Предсказанные белок-белковые взаимодействия были получены из STRING (Search Tool for the Retrieval of Interacting proteins database). Помимо первичного вовлечения в патологию RBCK1 дефицита, некоторые пути пониженной регуляции усиливают симптомы миопатии, кардиомиопатии и бактериальных заболеваний. Изученные сигнальные пути могут служить новыми мишенями в разработке компенсаторной терапии для пациентов с RBCK1 дефицитом.
Ключевые слова:
профилирование генетической экспрессии, аутовоспалительные заболевания, RBCK1, сигнальные пути, белок-белковые взаимодействия.
Материал поступил в редакцию 24.06.2022, 17.07.2022, опубликован 09.08.2022
Образец цитирования:
E. I. Demicheva, Kh. Shinwari, K. S. Ushenin, M. A. Bolkov, “Additional pathogenic pathways in RBCK1 deficiency”, Матем. биология и биоинформ., 17:2 (2022), 174–187
Образцы ссылок на эту страницу:
https://www.mathnet.ru/rus/mbb484 https://www.mathnet.ru/rus/mbb/v17/i2/p174
|
Статистика просмотров: |
Страница аннотации: | 40 | PDF полного текста: | 12 | Список литературы: | 15 |
|