|
Эта публикация цитируется в 5 научных статьях (всего в 5 статьях)
Биоинформатика
Распознавание видов флавивирусов на основе кодирующих последовательностей полипротеинов
М. Б. Чалейa, Ж. С. Тюлькоb, В. А. Кутыркинc a Институт математических проблем биологии РАН – филиал ИПМ им. М.В. Келдыша РАН, Пущино, Московская область, Россия
b Омский государственный медицинский университет Минздрава России, Омск, Россия
c Московский государственный технический университет имени Н. Э. Баумана, Москва, Россия
Аннотация:
Предлагается метод распознавания вида флавивируса, включая распознавание подтипа, по последовательности его генома. Метод основан на использовании частотных характеристик кодонов аминокислот в полных кодирующих последовательностях полипротеинов. Высокая надежность этого метода подтверждается при распознавании 15 групп геномов флавивирусов различных видов и подтипов, имеющих достаточное количество представителей в GenBank. Рассматриваются десять различных видов флавивирусов, четыре подтипа вируса лихорадки денге и вирус Кунджин, как подтип вируса лихорадки Западного Нила.
Материал поступил в редакцию 28.08.2019, 13.11.2019, опубликован 19.11.2019
Образец цитирования:
М. Б. Чалей, Ж. С. Тюлько, В. А. Кутыркин, “Распознавание видов флавивирусов на основе кодирующих последовательностей полипротеинов”, Матем. биология и биоинформ., 14:2 (2019), 533–542
Образцы ссылок на эту страницу:
https://www.mathnet.ru/rus/mbb401 https://www.mathnet.ru/rus/mbb/v14/i2/p533
|
Статистика просмотров: |
Страница аннотации: | 80 | PDF полного текста: | 75 | Список литературы: | 15 |
|